农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(3) :481-494.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.03.008

基于转录组的紫薇TCP基因家族分析

Transcriptome-wide Profiling of the TCP Gene Family in Lagerstroemia indica

张烨 刘洁茹 冯露 周杨 蔡明 程堂仁 王佳 张启翔 潘会堂
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(3) :481-494.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.03.008

基于转录组的紫薇TCP基因家族分析

Transcriptome-wide Profiling of the TCP Gene Family in Lagerstroemia indica

张烨 1刘洁茹 1冯露 1周杨 1蔡明 1程堂仁 1王佳 1张启翔 1潘会堂1
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作者信息

  • 1. 北京林业大学园林学院/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室,北京100083
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摘要

TCP(teosinte branched 1,cycloidea,proliferating cell factors)转录因子作为植物所特有的一类转录因子,广泛参与植物的生长发育、形态发生、非生物胁迫等生理过程,能够调节下游靶基因的表达以调控细胞分裂,在多种激素调控通路中发挥作用.紫薇(Lagerstroemia indica)是优良的夏季观花木本植物,株型多样,为明确TCP基因家族在紫薇株型中的作用,本研究基于转录组数据在紫薇中鉴定出44个TCP基因,并进行相应的生物信息学分析以及表达量检测.结果表明,紫薇TCP转录因子家族成员编码的蛋白理化性质均匀稳定,多定位于细胞核中;进化树分析表明紫薇TCP转录因子分为两个分支,其数量和占比与其他物种相似;各转录因子具有相对保守的结构,包含较完整的TCP保守结构域,且两个分支有明显的结构差异;各TCP转录因子在普通型和矮生型紫薇中大多表达水平相似,根据转录组表达量数据从中筛选出14个差异表达的TCP转录因子,其中LfiTCP12;2和LfiTCP15;2在两种株型紫薇中差异表达极显著,荧光定量PCR检测发现,其分别在矮生型紫薇中高表达和低表达.本研究为进一步研究紫薇TCP基因对株型性状的调控提供了基础资料,对推动木本花卉株型性状的分子育种进程具有重要意义.

关键词

紫薇/TCP转录因子/基因家族/生物信息学分析/表达分析

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基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量5
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