农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(3) :550-557.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.03.014

内蒙古白绒山羊CMTM2基因多态性与生长性状的关联分析

Correlation Analysis of CMTM2 Gene Polymorphism with Growth Traits in Inner Mongolia Cashmere Goats (Capra hircus)

王聪亮 李河林 许征宇 屈成 白晶晶 史雷 宋晓越 李陇平 屈雷 朱海鲸
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(3) :550-557.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.03.014

内蒙古白绒山羊CMTM2基因多态性与生长性状的关联分析

Correlation Analysis of CMTM2 Gene Polymorphism with Growth Traits in Inner Mongolia Cashmere Goats (Capra hircus)

王聪亮 1李河林 1许征宇 1屈成 1白晶晶 1史雷 1宋晓越 1李陇平 1屈雷 1朱海鲸2
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作者信息

  • 1. 榆林学院生命科学研究中心,榆林719000
  • 2. 榆林学院生命科学研究中心,榆林719000;陕西省'四主体一联合'肉羊工程技术校企联合研究中心,神木719318;陕西浩丽绒山羊科技发展有限公司,子洲718499
  • 折叠

摘要

趋化素样因子(chemokine-like factor,CKLF)超家族2(CKLF superfamily member,CKLFSF2),又称为CKLF样MARVEL穿膜结构域超家族2(CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing 2,CMTM2),在精子发生、骨骼形成和机体发育中发挥重要作用,因此推测CMTM2基因对动物的正常生长发育具有重要作用.为探讨CMTM2基因多态性与内蒙古白绒山羊(Capra hircus)群体生长性状的相关性,获得与生长相关的遗传标记,加速内蒙古白绒山羊和超细型绒山羊的育种进程,本研究以内蒙古白绒山羊母羊为研究对象(包括460只育成羊和215只成年羊),取耳组织提取DNA并进行PCR扩增,检测CMTM2基因的插入/缺失(insertion/deletion,InDel)突变,分析突变位点与生长性状的相关性.结果显示,在内蒙古白绒山羊CMTM2基因启动子区存在1个14-bp InDel突变;在育成羊和成年羊群体中产生I型和D型两种等位基因,I型等位基因频率均高于D型,均产生插入型(II)、杂合型(ID)和缺失型(DD)三种基因型;多态信息含量(polymorphic information content,PIC)分析显示,该InDel突变位点在育成羊和成年羊群体中均为中度多态(0.25<PIC<0.50);但在育成羊群体中InDel多态性不符合哈代温伯格平衡(P<0.05);关联分析发现,在育成羊群体中(n=460),该突变位点与十字部高显著相关(P<0.05);在成年羊群体中(n=215),该突变位点与体高(P<0.05)、胸围(P<0.05)、十字部高(P<0.01)、胸深(P<0.05)、绒细度(P<0.01)显著或极显著相关;进一步的关联分析发现,在育成羊和成年羊全部群体中(n=675),该突变位点与绒细度显著相关(P<0.05).上述结果提示,CMTM2基因启动子区14-bp InDel位点的多态性与内蒙古白绒山羊的部分生长性状存在显著或极显著相关性,并且不同的分析方法均显示该位点的多态性与绒细度显著相关.因此,CMTM2基因可作为内蒙古白绒山羊生长性状选育的候选基因.本研究为内蒙古白绒山羊及超细绒山羊选育提供参考依据.

关键词

CKLF样MARVEL穿膜结构域超家族2基因(CMTM2)/绒山羊/插入/缺失(InDel)/关联分析

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基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量13
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