人BLM基因相关LncRNAs的筛选及其在不同前列腺癌细胞中的表达分析

Screening of Human BLM Gene-related LncRNAs and Analysis of Its Expression in Different Prostate Cancer Cells

罗斌杰 ¹杨丽红 ¹李永 ¹谌颖莲 ²赵佳福 ³许厚强⁴

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作者信息

1. 贵州大学生命科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵阳550025
2. 贵州大学生命科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵阳550025;贵州大学医学院,贵阳550025
3. 贵州大学生命科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵阳550025
4. 贵州大学生命科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵阳550025;贵州大学医学院,贵阳550025
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摘要

BLM解旋酶(bloom helicase,BLM)在DNA的复制、修复、重组以及维持端粒的稳定性等各方面都具有重要作用,当BLM解旋酶基因发生突变时,易患BLM综合征,甚至引发多种癌症.为探究BLM解旋酶基因相关长链非编码RNAs(long coding RNAs,LncRNAs)的表达规律,本研究以调控BLM基因相关的miR-27b-3p为关联点,利用自主开发程序SWChen2.3筛选与BLM基因相关LncRNAs,分析BLM相关LncRNAs在3种不同株系的前列腺癌细胞PC3、Lncap、22RV-1和正常人的前列腺基质成纤维细胞系WPMY-1中的表达情况.利用自主开发程序SWChen2.3筛选BLM基因相关的LncRNAs,对候选的LncRNAs进行克隆,并对其二级结构、ORF及其与BLM基因相关靶位点进行预测和分析.结果成功筛选 NONHSAT203515.1(GenBank No.m130127_152334_00126_c100)(命名为BLNC203)和(GenBank No.lnc-ZBTB201∶1)(命名为BLNC246)作为研究对象,采用qRT-PCR的方法检测BLNC203和BLNC246在3种不同前列腺癌细胞和正常上皮细胞系中的表达情况.qRT-PCR结果显示2条LncRNAs在不同前列腺癌细胞中均有表达,且各细胞间表达差异明显,BLNC203在PC3、22RV-1中的表达量都极显著高于正常细胞(P＜0.01),在Lncap细胞中差异不显著(P＞0.05).BLNC246在PC3、Lncap细胞中表达量都极显著低于正常细胞(P＜0.01),在22RV-1细胞中不显著(P＞0.05).BLNC203有3个ORF,BLNC246有1个ORF,BLNC203二级结构最小自由能为-239.10 kcal/mol,BLNC246的最小自由能为-85.30 kcal/mol.本研究结果将为进一步研究LncRNAs/BLM对前列腺癌细胞增殖的影响机制提供一定的理论依据.

关键词

长链非编码RNA(LncRNA)/BLM解旋酶(BLM)/前列腺癌/qRT-PCR

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基金项目

国家自然科学基金(31860242)

出版年

2021

农业生物技术学报

中国农业大学中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：0.801

ISSN：1674-7968

参考文献量12

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