农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(5) :985-994.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.05.015

基于EF-1α序列位点特异性PCR快速鉴定小麦茎基腐病优势病原菌假禾谷镰孢菌

Rapid Identification of Main Pathogen Fusarium pseudograminearum of Wheat Crown Rot Using Site-specific PCR Based on EF-1α Sequence

刘国霞 谭晴晴 齐军山 王福玉 陈雪燕 范阳阳 胡悦 步迅 张全芳
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(5) :985-994.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.05.015

基于EF-1α序列位点特异性PCR快速鉴定小麦茎基腐病优势病原菌假禾谷镰孢菌

Rapid Identification of Main Pathogen Fusarium pseudograminearum of Wheat Crown Rot Using Site-specific PCR Based on EF-1α Sequence

刘国霞 1谭晴晴 1齐军山 2王福玉 3陈雪燕 1范阳阳 1胡悦 1步迅 1张全芳1
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作者信息

  • 1. 山东省农业科学院生物技术研究中心,济南250100
  • 2. 山东省农业科学院植物保护研究所,济南250100
  • 3. 济宁市农业科学研究院,济宁272031
  • 折叠

摘要

小麦茎基腐病(wheat crown rot,WCR)是影响小麦(Triticum aestivum)产量的重要病害,假禾谷镰孢菌(Fusarium pseudograminearum)是其优势病原菌,对病原菌快速准确的鉴定对于制定合理的防治措施及选育抗病品种具有重要意义.本研究通过分析常见镰孢菌延伸因子-1α(elongation factor-1α,EF-1α)基因序列,针对假禾谷镰孢菌的SNP位点设计了特异引物F.pseudo-F3/R1,利用降落PCR(touchdown PCR,TD PCR)和该特异PCR引物,可在假禾谷镰孢菌中扩增到334 bp单一条带,而在禾谷镰孢菌(F.graminearum)、三线镰孢菌(F.tricinctum)、层出镰孢菌(F.proliferatum)、变红镰孢菌(F.incarnatum)和尖孢镰孢菌(F.oxysporum)中均无扩增.利用2019~2020两年在山东济宁和济阳采集的小麦茎秆中分离的病菌对该位点特异性诊断PCR引物和扩增方法进行了验证.研究发现,2019年山东济宁小麦疑似茎基腐病样品中分离到28株真菌,使用F.pseudo-F3/R1仅在假禾谷镰孢菌中扩增到334 bp单一条带,其他小麦真菌如禾谷镰孢菌、木贼镰孢菌(f.equiseti),链格孢菌(Alternaria alternate)、根腐离蠕孢菌(Bipolaris sorokiniana)和禾谷丝核菌(Rhiizoctonia cerealis)中均无扩增.对2020年济宁田间表现为茎基腐病的小麦样品直接提取茎秆DNA,利用上述特异引物可扩增出假禾谷镰孢菌的特异条带,而在表现根腐、叶锈、白粉和枯白穗症状的小麦茎秆中则无扩增.经分离病菌测序鉴定,在茎基腐病小麦样品中有假禾谷镰孢菌和禾谷镰孢菌,而其他症状小麦中分离到禾谷镰孢菌和禾谷丝核菌.同时,在2020年济阳人工接种和自然感染的茎基腐病小麦茎秆的DNA中也可扩增到假禾谷镰孢菌的特异条带.上述研究表明,该方法特异性强,可直接用于小麦茎秆的假禾谷镰孢菌准确检测,为快速鉴别假禾谷镰孢菌提供了一种新方法.

关键词

小麦茎基腐病/假禾谷镰孢菌/病原菌/快速鉴定

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基金项目

山东省重点研发计划(2019GSF107085)

山东省现代农业产业技术体系小麦创新团队(SDAIT-01-10)

山东省农业科学院农业科技创新工程产业团队(CXGC2016A11)

国家自然科学基金(31901543)

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量5
参考文献量7
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