农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(6) :1206-1214.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.06.018

xCas9及SpCas9-NG切刻突变体的构建及活性评价

Construction and Activity Evaluation of xCas9 and SpCas9-NG Nicking Mutants

张宁 秦怀远 辛京京 赵金山 包汉勋 李和刚
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(6) :1206-1214.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.06.018

xCas9及SpCas9-NG切刻突变体的构建及活性评价

Construction and Activity Evaluation of xCas9 and SpCas9-NG Nicking Mutants

张宁 1秦怀远 1辛京京 1赵金山 1包汉勋 2李和刚1
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作者信息

  • 1. 青岛农业大学动物科技学院,青岛266109
  • 2. 胶州市农业农村局,青岛266300
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摘要

通常使用的CRISPR/Cas9系统仅能识别靶标序列为NGG的原间隔序列临近基序(protospacer adjacent motif,PAM),而进化的xCas9、SpCas9-NG系统可识别序列为NG的PAM,扩大了 靶标的识别范围,但脱靶效应却一直阻碍CRISPR/Cas9系统的发展,而双切刻系统会增加DNA的靶向特异性.为了提高PAM为NG的CRISPR/Cas9系统基因编辑的特异性,本研究设计并构建xCas9-D10A、SpCas9-NG-D10A、xCas9-H840A、SpCas9-NG-H840A 四个切刻突变体以及相应的单链向导 RNA(single guide RNA,sgRNA)表达载体,与双荧光素酶报告基因载体SSA-DKK2、SSA-DKK1构成特定的组合,共转染绵羊(Ovis aries)成纤维细胞,通过双荧光素酶活性检测的方式来验证DNA切割效率.结果表明,SpCas9-NG-Dl0A、SpCas9-NG-H840A突变体针对多数靶标载体其报告基因活性显著大于对照组(P<0.05),xCas9-H840A突变体完全没有活性,而xCas9-D10A仅在DKK1基因中表现出切割活性.相对而言,SpCas9-NG-D10A突变体活性稳定,切割DNA单链效率较高,故此载体可用于进一步的研究应用.本研究结果对于PAM为NG的CRISPR/Cas9双切刻系统的进一步研究及应用提供了重要的参考数据.

关键词

CRISPR/Cas9/双切刻系统/双荧光素酶检测/突变体/原间隔序列临近基序(PAM)

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基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量5
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