农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(7) :1417-1425.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.07.018

马铃薯黑痣病菌实时荧光定量PCR检测体系的建立及应用

Establishment and Application of Real-time Quantitative PCR Detection System for Black Scurf Pathogen in Potato(Solanum tuberosum)

李磊 陈利达 黄艺烁 谢学文 石延霞 柴阿丽 李宝聚
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(7) :1417-1425.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.07.018

马铃薯黑痣病菌实时荧光定量PCR检测体系的建立及应用

Establishment and Application of Real-time Quantitative PCR Detection System for Black Scurf Pathogen in Potato(Solanum tuberosum)

李磊 1陈利达 1黄艺烁 1谢学文 1石延霞 1柴阿丽 1李宝聚1
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作者信息

  • 1. 中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
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摘要

立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)是马铃薯(Solanum tuberosum)黑痣病的病原菌,严重威胁着马铃薯产业的发展.立枯丝核菌在土壤中主要以菌核结构作为初侵染源进行潜伏休眠,其密度与马铃薯黑痣病的发病程度呈正相关.为快速准确地检测土壤中立枯丝核菌和菌核的密度,本研究基于立枯丝核菌融合群3(anastomosis group 3,AG3)的翻译延长因子(translation elongation factor,TEF)保守区域,设计特异性引物TEF3/TEF7,以191-bp扩增产物的重组质粒为标准品,构建实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测体系,其灵敏度(19.5 fg/μL)为普通PCR 1 000倍.采用普通PCR和qPCR方法,对4个地区的疑似马铃薯黑痣病薯(18份)和病土(41份)的DNA进行检测,2种检测方法对马铃薯黑痣病薯的检出率均为100%;普通PCR对病土的检出率为65.85%,qPCR对病土的检出率为97.56%.为明确田间早期病土检测的带菌量,人工模拟不同带菌核量的土壤,结合水筛法进行qPCR检测,建立循环域值(cycle threshold,Ct)与土壤中菌核含量的曲线关系,回归方程为y=-3.982x+12.687,相关系数R2为0.986,呈良好线性关系;人工模拟带菌量检测下限为每克土5×10-6g.本研究建立的检测体系能够快速、准确地检测土壤中立枯丝核菌AG3的菌核密度.在种植前对大田土壤中立枯丝核菌含量进行定量检测,可为马铃薯黑痣病的早期预警提供技术支持.

关键词

马铃薯黑痣病/实时荧光定量PCR/水筛法/土壤检测

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基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量3
参考文献量9
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