农业生物技术学报2021，Vol.29Issue(8) ：1473-1484.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.08.004

不同种植密度下玉米籽粒容重全基因组关联分析

Genome-wide Association Study of Maize (Zea mays) Kernel Test Weight Under Different Planting Densities

袁凡 郑云霄 刘强 黄亚群 刘涵 赵永锋 贾晓艳 祝丽英 陈景堂 郭晋杰
农业生物技术学报2021，Vol.29Issue(8) ：1473-1484.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.08.004
✕
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据

不同种植密度下玉米籽粒容重全基因组关联分析

Genome-wide Association Study of Maize (Zea mays) Kernel Test Weight Under Different Planting Densities

袁凡 1郑云霄 1刘强 1黄亚群 1刘涵 2赵永锋 1贾晓艳 1祝丽英 1陈景堂 3郭晋杰1
扫码查看

作者信息

  • 1. 河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心/河北省作物种质资源实验室,保定071001
  • 2. 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室/国家玉米改良中心,北京100193
  • 3. 河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心/河北省作物种质资源实验室,保定071001;青岛农业大学农学院,青岛266109
  • 折叠

摘要

玉米(Zea mays)是我国主要粮饲作物,容重是评价玉米品质等级的指标.随着耐密植玉米品种的选育和推广逐渐增多,种植密度对玉米品质的影响受到育种者的关注.本研究以248份遗传多样性丰富的玉米自交系为关联群体,在多环境不同种植密度下对容重性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),利用分布于全基因组的83057个SNP标记,探究种植密度对容重性状影响,挖掘容重相关位点和控制容重的候选基因.结果发现种植密度对容重性状影响显著,'XF134'、'4676A'、'811A'、'吉4112'等自交系受密度影响较小可以保持较高的容重,适合在密植环境下种植.本研究共检测到14个显著SNP位点,分别位于1、3、4、5、6、7和10号染色体上,单个位点表型贡献率(phenotypic variance explained,PVE)为1.84％～30.91％.该群体的衰减距离为120 kb,在此范围搜索显著SNP位点上下游共发现72个候选基因,可归类到7类生物过程,8类细胞组成,6类分子功能.推测得到7个可能与籽粒容重相关的候选基因GRMZM2G079263、GRMZM2G079617、GRMZM2G403609、GRMZM2G180659、GRMZM2G160840、GRMZM2G104254、GRMZM2G057281,这些基因可能参与胚乳发育,光合作用以及抵抗逆境等影响容重品质的调节.本研究为后续进一步探究容重遗传原理和机制以及分子辅助选择育种提供了帮助.

关键词

玉米/籽粒容重(KTW)/全基因组关联分析(GWAS)

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
被引量1
参考文献量21
段落导航相关论文