摘要
在卵巢卵泡发育过程中,卵母细胞与周围颗粒细胞之间形成缝隙连接通道,介导胞间通讯和物质转运,缝隙连接内在化可导致缝隙连接降解,是由网格蛋白介导的内吞过程(clathrin-mediated endocytosis,CME).为了揭示CME对从江香猪(Sus scrofa)卵巢功能的调节作用,本研究以未发情期为对照,利用转录组测序技术,通过Limma、DESeq2和rMATS等软件以及逆转录PCR等技术,分析从江香猪发情期卵巢CME相关基因的表达和转录本发生的可变剪接.从江香猪卵巢中检测到8个CME基因表达,包括DAB衔接蛋白2(DAB adaptor protein 2,DAB2),衔接蛋白复合体2亚基μ1(adaptor related protein complex 2 subunitμ1,AP2M1),网格蛋白轻链(clathrin light chain,CLT)A(CLTA)和B(CLTB),动力蛋白1(dynamin-1,DNM1),肌球蛋白Ⅵ(myosinⅥ,MYO6),动力蛋白2(dynamin-2,DNM2)和网格蛋白重链(clathrin heavy chain,CLTC),其中差异表达的基因有DAB2、AP2M1和CLTB;除了CLTB外,其余7个基因在发情和未发情卵巢之间发生差异的可变剪接,这些可变剪接产生的7个转录本是目前Ensembl数据库暂未收录的新转录本.说明可变剪接是从江香猪发情过程中卵巢功能重要的调控方式,以CME过程中产生新的转录本和蛋白的方式组建蛋白互作网络.结果表明,通过转录和转录后水平调控CME相关基因的表达和转录本的剪接,来影响缝隙连接的内在化,从而调节从江香猪卵巢的功能.本研究有助于提高对猪转录后调控过程的认识,对从转录组水平解析猪卵巢功能的分子调节机制具有重要意义.
国家科技期刊平台
NSTL
维普
万方数据