农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(9) :1817-1824.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.09.016

纳米孔测序技术在植物病原检测中的应用与展望

Application and Prospect of Nanopore Sequencing Technology in Plant Pathogen Detection

路惠馨 孙凯 尹传林 黄昱栋 俞晓平
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(9) :1817-1824.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.09.016

纳米孔测序技术在植物病原检测中的应用与展望

Application and Prospect of Nanopore Sequencing Technology in Plant Pathogen Detection

路惠馨 1孙凯 1尹传林 1黄昱栋 1俞晓平1
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作者信息

  • 1. 中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室,杭州310018
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摘要

植物病原微生物严重威胁农作物的产量和品质,建立高效准确的病原诊断技术是病害防控的重要措施.基于二代测序(next generation sequencing,NGS)平台的宏基因组测序技术是植物病害鉴定的重要工具.然而由于其检测成本高,实验周期长,设备笨重以及依赖生物信息学技术等缺点,制约了NGS在植物病原快速检测中的应用.牛津纳米孔技术公司(英国,牛津)研发的纳米孔测序技术是一种新型的测序平台,与传统二代测序平台相比,具有成本低、实验周期短、使用方便等优势,适合于现场快速检测.本文介绍了纳米孔测序的技术原理,概述了近年来此技术在植物病原检测领域的应用与挑战,以期为该技术在植物病原检测中的进一步应用与改进提供参考.

关键词

纳米孔测序/第三代测序技术/植物病原体检测

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基金项目

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量2
参考文献量4
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