农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(10) :2008-2015.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.10.015

伪狂犬病病毒Ⅱ型感染PK-15细胞的转录组学分析

Transcriptomic Analysis of PK-15 Cells Infected with Pseudorabies virus TypeⅡ

李海敏 俞天奇 金玉兰 顾金燕 周继勇
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(10) :2008-2015.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.10.015

伪狂犬病病毒Ⅱ型感染PK-15细胞的转录组学分析

Transcriptomic Analysis of PK-15 Cells Infected with Pseudorabies virus TypeⅡ

李海敏 1俞天奇 1金玉兰 1顾金燕 1周继勇1
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作者信息

  • 1. 浙江大学动物医学中心/农业农村部动物病毒学重点实验室,杭州310058
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摘要

伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)感染猪(Sus scrofa)可引起烈性接触性传染病,即伪狂犬病(Pseudorabies,PR),临床上主要通过疫苗免疫进行防控.PRV变异株(PRVⅡ型)的流行使传统疫苗失去有效保护.近年来出现PRV跨宿主感染人(Homo sapiens)的案例,更使PRV成为全球公共卫生威胁,但其感染致病机制仍不完全清楚.为从分子水平上全面了解PRV感染宿主细胞引起的变化,本研究以PRVⅡ型毒株PRV-DX感染猪肾细胞PK-15,通过高通量测序获得PRV感染后全部的细胞差异转录组数据,并对差异表达基因进行功能富集.结果表明,PRV-DX感染PK-15可引起3595条基因表达上调、3604条基因表达下调.通过qPCR验证随机选择的12条差异表达基因,其变化趋势与转录组数据一致.GO注释和KEGG信号通路富集将差异表达基因聚焦在代谢、基因表达、免疫等信号通路.本研究为深入解析PRV感染的致病机制提供了重要基础数据及研究方向.

关键词

伪狂犬病病毒Ⅱ型(PRVⅡ)/高通量测序/差异转录组

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基金项目

浙江省重点研发计划(2020C02011)

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量2
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