农业生物技术学报2021，Vol.29Issue(11) ：2087-2098.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.11.003

马铃薯StERF109基因的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StERF109 Gene in Potato (Solanum tuberosum)

王芳芳 杨江伟 朱熙 李世贵 刘维刚 张宁 司怀军
农业生物技术学报2021，Vol.29Issue(11) ：2087-2098.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.11.003
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马铃薯StERF109基因的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StERF109 Gene in Potato (Solanum tuberosum)

王芳芳 1杨江伟 2朱熙 3李世贵 3刘维刚 3张宁 1司怀军2
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070
  • 2. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070;甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地,兰州730070
  • 3. 甘肃农业大学农学院,兰州730070
  • 折叠

摘要

乙烯响应因子(ethylene responsive factors,ERFs)属于APETALA2/乙烯响应因子(APETALA2/ethylene responsive factor,AP2/ERF)超家族,是植物中最大的转录因子家族之一.研究表明,ERFs参与植物的生长发育、信号转导、生物和非生物胁迫等多种生物学过程.为了研究马铃薯(Solanum tuberosum)StERF109基因(GenBank No.XM_006355301.2)的功能,本研究对其进行了生物信息学分析,构建了StERF109的亚细胞定位融合表达载体StERF109-EGFP,并对StERF109基因进行了定位;利用qPCR技术对StERF109进行了组织特异性表达分析.结果表明:StERF109含有1个典型的AP2结构域,为亲水蛋白,不含跨膜结构;亚细胞定位结果显示StERF109定位于细胞核和细胞膜上;组织差异性表达分析显示StERF109基因在马铃薯根中表达量最高,茎和叶中表达量存在品种差异,在干旱和盐胁迫下均上调表达,提示StERF109基因在干旱和盐胁迫中发挥重要功能.本研究为进一步深入研究马铃薯StERF109基因的功能提供了参考.

关键词

马铃薯/马铃薯乙烯响应因子109/(StERF109)/生物信息学/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金(31960444)

国家自然科学基金(31860399)

甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地主任基金(GSCS-2019-Z03)

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
被引量4
参考文献量6
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