农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(4) :619-627.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.001

六种水稻病毒一步法多重RT-PCR快速检测方法的建立

Establishment of a Rapid One-step Multiplex RT-PCR Detection Method for Six Rice Viruses

黄静 王晨一 兰彬源 丁新伦 张帅 吴建国
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(4) :619-627.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.001

六种水稻病毒一步法多重RT-PCR快速检测方法的建立

Establishment of a Rapid One-step Multiplex RT-PCR Detection Method for Six Rice Viruses

黄静 1王晨一 2兰彬源 2丁新伦 2张帅 2吴建国2
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作者信息

  • 1. 漳州职业技术学院食品工程学院,漳州363000;福建农林大学媒介病毒研究中心,福州350002
  • 2. 福建农林大学媒介病毒研究中心,福州350002
  • 折叠

摘要

农业生产上水稻(Oryza sativa)病毒病的发生大多为复合侵染,仅通过病毒病症状学的诊断往往很难准确分辨,因此开发快速精准诊断多种水稻病毒病的检测技术,对于水稻病毒病害的精准测报具有重要应用价值.基于此,本研究根据当前我国南方农业生产上常见的6种水稻病毒,即水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)、水稻草状矮化病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)、水稻矮缩病毒(Rice dwarf virus,RDV)、水稻锯齿叶矮缩病毒(Rice ragged stunt virus,RRSV)、水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV)和南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)的外壳蛋白(coat protein,CP)的基因序列,设计了特异性检测引物,建立了可同时检测6种病毒的一步法多重逆转录PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)体系,其结果表明一步法多重RT-PCR检测反应体系(总体系20μL)中,RSV上下游引物浓度为10μmol/L的体积加量为0.6μL、RDV为0.4μL、RGSV为0.3μL、RRSV为0.4μL、RBSDV为0.6μL、SRBSDV为0.2μL;Onestep RT/Taq Mix的用量确认为0.75μL,5×反应缓冲液用量为4μL,模板量为1μg.多重RT-PCR参数设定为RNA反转录50℃30 min;预变性94℃2 min;94℃变性30 s;退火温度58℃,30 s;72℃延伸1 min,35个循环;72℃终延伸10 min.研究结果表明该体系可同时高效精准地检测6种水稻病毒,极大地提高了检测效率;该方法可广泛应用于实验室精准检测、田间水稻病毒病和传毒介体的检测,也为相关产品的研发提供技术支持和参考依据.

关键词

水稻病毒/多重RT-PCR/病毒检测

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基金项目

国家自然科学基金青年科学基金(31901851)

福建省科技计划面上项目(2109J01371)

国家杰出青年科学基金(32025031)

漳州市自然科学基金(ZZ2021J02)

2020年度漳州市访学进修计划(漳人社202027号)

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量2
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