农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(4) :817-824.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.020

鸭星状病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立

Establishment of SYBR GreenⅠReal-time Quantitative PCR Assay for Detecting Duck astrovirus-3

傅秋玲 张蕊 傅光华 万春和 程龙飞 施少华 陈红梅 刘荣昌 黄瑜
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(4) :817-824.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.020

鸭星状病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立

Establishment of SYBR GreenⅠReal-time Quantitative PCR Assay for Detecting Duck astrovirus-3

傅秋玲 1张蕊 2傅光华 1万春和 1程龙飞 1施少华 1陈红梅 1刘荣昌 1黄瑜1
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作者信息

  • 1. 福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013;福建省禽病防治重点实验室,福州350013
  • 2. 福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013
  • 折叠

摘要

鸭星状病毒3型(Duck astrovirus-3,DAstV-3)是近年来危害我国养鸭业的新发病原.本研究根据前期从樱桃谷鸭(Anas platyrhynchos domestica)胚中分离鉴定的DAstV-3分离株及已报道毒株的RNA依赖性的核糖核酸聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)特征设计特异性引物,建立检测DAstV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法.结果表明,该方法的标准曲线循环域值(Ct)与标准品模板浓度在1.15×101~1.15×107拷贝/μL间线性关系良好,相关系数R2和扩增效率分别为0.999和2.08;该方法特异性强,仅可检出DAstV-3,而对鸭常见疫病病原(DAstV-1,DAstV-2,禽流感病毒H9(H9 subtype Avian influenza virus),禽坦布苏病毒(Avian tambusu virus),鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus),番鸭细小病毒(Muscovy parvovirus))检测均为阴性;灵敏度高,其最低检测下限为23拷贝;并且重复性好,批内和批间重复试验变异系数分别为0.14%~0.65%和0.53%~0.94%,均低于1%.利用该方法对2018年6月至2021年3月的209份疑似DAstV-3感染病例样品进行检测,DAstV-3的阳性检出率为56.5%(118/209).综上结果表明,本研究所建立的方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,为DAstV-3感染的快速诊断和流行病学监测提供了有力的技术支持.

关键词

鸭星状病毒3型(DAstV-3)/RNA依赖性的核糖核酸聚合酶(RDRP)/SYBR/GreenⅠ/实时荧光定量PCR

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基金项目

福建省科研院所公益性行业专项()

福建省农业科学院青年英才项目(YC2019010)

福建省农业科学院国家基金培育项目(GJPY2019001)

国家现代农业(水禽)产业技术体系项目(CARS-42-18)

江西省双千计划人才项目(jxsq2018102118)

福建省农业科学院禽病防控重点创新团队项目(CXTD2021005-1)

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量4
参考文献量4
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