农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(5) :861-872.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.05.004

绿豆GRAS基因家族鉴定及其非生物胁迫下的表达模式分析

Identification of GRAS Gene Family and Its Expression Pattern Analysis Under Abiotic Stress in Vigna radiata

张文慧 何光鑫 王子鑫 周鹏 徐红岩 张琦 杜吉到
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(5) :861-872.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.05.004

绿豆GRAS基因家族鉴定及其非生物胁迫下的表达模式分析

Identification of GRAS Gene Family and Its Expression Pattern Analysis Under Abiotic Stress in Vigna radiata

张文慧 1何光鑫 1王子鑫 1周鹏 1徐红岩 1张琦 1杜吉到1
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作者信息

  • 1. 黑龙江八一农垦大学农学院,大庆163319
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摘要

GRAS(gibberellic acid insensitive(GAI),repressor of GAI(RGA),and scarecrow(SCR))基因家族广泛存在于植物中,对于植物响应逆境胁迫及生长、发育等方面起重要作用.绿豆(Vigna radiata)是我国传统的经济作物,抗逆性强,是盐碱土壤改良的优良作物之一.本研究鉴定出58个绿豆GRAS基因,并对这些基因进行生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式分析.结果表明,GRAS基因不均匀的分布在绿豆的1~11号染色体上;系统进化分析将GRAS基因分为8个亚家族(PAT1,DELLA,SCL3,LISCL,LS,SCR,SHR和HAM),同一亚家族的VrGRAS蛋白有相似的蛋白基序;基因结构分析发现绿豆GRAS内含子较少,在不同物种中具有较高的保守性;启动子区域含有脱落酸、乙烯、茉莉酸甲酯等激素响应元件以及胁迫响应元件;qPCR结果显示,绿豆GRAS基因在叶片中能够不同程度的响应盐、干旱、碱和低温等非生物胁迫,且表达具有组织特异性.PAT1亚家族基因对绿豆响应逆境胁迫起重要的调控作用.本研究结果可为绿豆GRAS家族基因的抗逆功能分析提供参考.

关键词

绿豆/GRAS基因家族/非生物胁迫/表达模式

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基金项目

国家自然科学基金(31600532)

黑龙江八一农垦大学三横三纵支持计划(ZRCPY202001)

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量2
参考文献量5
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