农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(7) :1290-1302.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.07.006

山苍子WRKY基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of WRKY Gene Family in Litsea cubeba

苏文娟 陈霞 曹瑞兰 陈尚钘 刘洲莹 刘娟
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(7) :1290-1302.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.07.006

山苍子WRKY基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of WRKY Gene Family in Litsea cubeba

苏文娟 1陈霞 1曹瑞兰 1陈尚钘 1刘洲莹 1刘娟1
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作者信息

  • 1. 江西农业大学林学院/江西省森林培育重点实验室,南昌330045
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摘要

山苍子(Litsea cubeba)是我国南方地区重要的木本香料树种之一,在生长过程中极易遭受生物和非生物胁迫影响.WRKY转录因子在植物生长发育、胁迫应答等过程中发挥着重要作用.本研究基于生物信息学分析,鉴定出41个LcWRKY家族基因,利用转录组数据和qPCR验证,分析并探讨其在不同组织中的表达特异性.系统进化发育显示,LcWRKY家族成员分为2个类群,其中第2个类群包含5个亚类Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e.对LcWRKY基因的保守基序和结构域进行分析,结果证实了系统发育聚类分析的准确性.蛋白互作网络共表达分析表明,LcWRKY36、LcWRKY38和LcWRKY39等处于共线中心,推测其在山苍子响应病害、低磷胁迫等调控过程中起着关键作用.不同组织的转录组分析发现,41个LcWRKY成员在不同组织中差异表达,其中LcWRKY1、LcWRKY3、LcWRKY8等10个基因在根中呈现明显的高表达,LcWRKY8在根中的表达量是叶中的25倍(P<0.01),推测其在根系发育和逆境胁迫中发挥重要作用.此外,LcWRKY29、LcWRKY10、LcWRKY15、LcWRKY22和LcWRKY1等基因在果实中的相对表达量较高,推测其可能参与山苍子果实柠檬醛等次生代谢产物的生物合成.本研究为进一步解析山苍子WRKY转录因子的功能提供基础资料.

关键词

山苍子/WRKY基因家族/生物信息学分析/表达分析

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
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