农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(8) :1622-1631.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.08.017

苦荞薄壳性紧密连锁SSR标记的开发及验证

Development and Validation of SSR Markers Closely Linked to Thin Shell in Tartary Buckwheat (Fagopyrum tataricum)

陈峥峰 薛贤滨 黎瑞源 贾琼 陈庆富 石桃雄
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(8) :1622-1631.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.08.017

苦荞薄壳性紧密连锁SSR标记的开发及验证

Development and Validation of SSR Markers Closely Linked to Thin Shell in Tartary Buckwheat (Fagopyrum tataricum)

陈峥峰 1薛贤滨 1黎瑞源 2贾琼 1陈庆富 1石桃雄1
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作者信息

  • 1. 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心,贵阳, 550001
  • 2. 贵州省信息与计算重点实验室,贵阳, 550001
  • 折叠

摘要

苦荞(Fagopyrum tataricum)是我国重要的杂粮作物之一,其果壳类型不同导致脱壳效率不同,对苦荞产业发展有很大的影响.目前关于苦荞果壳类型的分子标记研究较少.为给苦荞果壳特性的改良及苦荞种质果壳类型的早期判断提供参考和选择依据,本研究开发并验证了与苦荞薄壳特性紧密连锁的SSR分子标记.结果表明,在薄壳基因1.4 Mb的定位区间内共扫描到286个SSRs,其中单核苷酸和二核苷酸重复类型数目最多,分别为92个和103个,出现次数最多的基序分别是A/T和AT/AT;SSRs重复次数大多集中在4~10次.共成功设计、合成了186对SSR引物,其中5对具有多态性的SSR标记与RILs群体的果壳类型形态学标记(a7GK)的连锁分析表明,SSR标记FtgGKssr-149和FtgGKssr-175与果壳类型连锁最紧密.对32个苦荞品种(系)果壳率和多态性SSR标记的关联分析表明,标记FtgGKssr-147、FtgGKssr-149和FtgGKssr-175与果壳率显著或极显著关联.本研究得到了3个与果壳类型紧密连锁以及和果壳率显著关联的SSR标记,可用于薄壳苦荞种质的分子标记辅助选择,对加速薄壳苦荞品种的育种进程具有重要意义.

关键词

苦荞/薄壳基因/SSR分子标记

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量18
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