农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1662-1675.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.002

水稻种子耐贮性全基因组关联分析

Genome Wide Association Study of Rice (Oryza sativa) Seed Storability

何兮 闫蕴韬 桂金鑫 李彬燕 莫茜 吴心成 张海清 贺记外
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1662-1675.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.002

水稻种子耐贮性全基因组关联分析

Genome Wide Association Study of Rice (Oryza sativa) Seed Storability

何兮 1闫蕴韬 1桂金鑫 1李彬燕 1莫茜 1吴心成 1张海清 1贺记外1
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作者信息

  • 1. 湖南农业大学农学院,长沙410128
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摘要

水稻(Oryza sativa)种子耐贮性是粮食安全和用种安全的重要保障,发掘水稻种子耐贮性QTL位点并筛选优异的耐贮单倍型是水稻耐贮性遗传改良的基础.本研究以431份来自全球3000份水稻(3K水稻)资源的核心种质为研究材料,2019和2020年分别在湖南长沙和海南三亚进行分期播种,使得各试验材料成熟期基本保持一致.收获的种子经自然贮藏和人工老化处理后进行耐贮性鉴定,结合基因型数据进行水稻种子耐贮性全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS),以P<1×10-4为阈值,重复检测到14个耐贮性QTL位点,分布在水稻2、3、5、8、9、10、11和12号染色体上,解释的表型变异为5%~24%,qSS3-2和qSS5-2为新QTL.在这14个QTL区间内共挖掘到17个与水稻种子耐贮性相关的候选基因,对qSS5-2区间内的候选基因进行单倍型分析,鉴定到了8种水稻种子耐贮单倍型.本研究结果为水稻耐贮性遗传改良提供理论参考与重要基因资源.

关键词

水稻/种子耐贮性/全基因组关联分析(GWAS)/QTL

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量5
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