农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1737-1746.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.008

钩藤不同部位总RNA提取及UrSTR基因的克隆与表达分析

Extraction of Total RNA and Cloning and Expression Analysis of UrSTR Gene from Uncaria rhynchophylla

穆德添 万凌云 韦树根 吴长桥 潘丽梅 柳亦松 田艺 付金娥 唐其
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1737-1746.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.008

钩藤不同部位总RNA提取及UrSTR基因的克隆与表达分析

Extraction of Total RNA and Cloning and Expression Analysis of UrSTR Gene from Uncaria rhynchophylla

穆德添 1万凌云 2韦树根 2吴长桥 1潘丽梅 2柳亦松 3田艺 1付金娥 2唐其1
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作者信息

  • 1. 湖南农业大学园艺学院,长沙410128
  • 2. 广西壮族自治区药用植物园,南宁510023
  • 3. 湖南农业大学动物医学院,长沙410128
  • 折叠

摘要

钩藤(Uncaria rhynchophylla)为我国常用大宗中药材之一,主治头痛眩晕、阿尔茨海默和高血压等症,其有效成分主要为萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs).异胡豆苷合酶(strictosidine synthase,STR)是TIAs生物合成途径中的关键酶,目前在钩藤中还未见报道.为了寻找参与钩藤TIAs生物合成的STR基因,本研究采用LC-MS法测定钩藤的根、叶片、茎钩、蒴果等不同部位中钩藤碱和异钩藤碱的含量,比较筛选4种总RNA提取方法.全长克隆了1条可能参与钩藤TIAs生物合成的候选基因UrSTR,并进行了生物信息学分析,利用qPCR分析了UrSTR在钩藤不同部位中的表达模式.结果表明:(1)通过LC-MS法测定,钩藤碱与异钩藤碱在钩藤蒴果中含量最高,根中含量最低.(2)改良CTAB法为钩藤不同部位总RNA的最佳提取方法.(3)UrSTR基因全长为1122 bp,编码一条374个氨基酸的肽链,具有跨膜螺旋结构,理论分子量为41.446 kD,理论等电点为7.549,在进化分析中发现,其与阿拉比卡咖啡(Coffea arabica)和中果咖啡(C.canephora)的STR基因聚为一类,亲缘关系较近.(4)qPCR结果显示,UrSTR基因主要在钩藤蒴果中表达,根中的表达量最低.通过分析发现,UrSTR基因的表达量与钩藤碱/异钩藤碱含量的趋势一致,提示UrSTR基因可能是钩藤STR候选基因之一,参与了TIAs的生物合成.本研究为UrSTR基因的功能验证和钩藤生物碱合成途径的解析提供了参考.

关键词

钩藤/改良CTAB法/单萜吲哚生物碱/异胡豆苷合酶

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量10
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