农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1771-1782.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.011

瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析

Cloning of Commd9 Gene in Amur ide (Leuciscus waleckii) and Its Expression Analysis Under Alkalinity Stress

罗亮 常玉梅 孙博 张立民 陈炯 梁利群
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1771-1782.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.011

瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析

Cloning of Commd9 Gene in Amur ide (Leuciscus waleckii) and Its Expression Analysis Under Alkalinity Stress

罗亮 1常玉梅 2孙博 2张立民 2陈炯 3梁利群2
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作者信息

  • 1. 宁波大学海洋学院/生物化学与分子生物学实验室宁波315832;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所/黑龙江省特殊生境鱼类种质特性与抗逆育种重点实验室哈尔滨150070
  • 2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所/黑龙江省特殊生境鱼类种质特性与抗逆育种重点实验室哈尔滨150070
  • 3. 宁波大学海洋学院/生物化学与分子生物学实验室宁波315832
  • 折叠

摘要

铜转运Murr1结构域(copper metabolism Murr1 domain,COMMD)蛋白家族在生物体中广泛存在,参与机体核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)活性调节、钠转运、铜代谢以及缺氧的适应性调节等生物学过程.为研究Commd9在碱度胁迫下的作用,本研究采用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次对具有耐高碱特性的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)Commd9基因cDNA全长进行了克隆,命名为LwCommd9基因(GenBank No.MT013199).该序列全长为938 bp,5'和3'非编码区分别为5和339 bp,开放阅读框为594 bp,编码蛋白含197个氨基酸,预测分子量为21.79 kD,理论等电点为5.63.系统发育分析显示,瓦氏雅罗鱼COMMD9氨基酸序列与鲤科鱼类的相似性较高,其中与鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)相似性高达93.37%.qPCR发现,LwCommd9基因在各组织中均有分布,在肝和肾组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05).高碳酸盐碱度胁迫下,LwCommd9基因在碱水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著下调(P<0.01),而在淡水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著上调(P<0.01),在肾组织中也有相同变化趋势.综上所述,LwCommd9基因在瓦氏雅罗鱼高碱适应过程中可能起到了关键作用,这将为后续鱼类耐高碱机制研究提供参考.

关键词

瓦氏雅罗鱼/铜转运Murr1结构域9/(Commd9)基因/基因表达/碱度胁迫

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量1
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