农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1810-1822.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.014

植物病原真菌RNA甲基转移酶的筛选与分析

Screening and Analysis of RNA Methyltransferase From Plant Pathogenic Fungi

贾明轩 周贺 王茂存 孙菡笛 程圳 范永山 巩校东 谷守芹 刘玉卫 董金皋
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(9) :1810-1822.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.014

植物病原真菌RNA甲基转移酶的筛选与分析

Screening and Analysis of RNA Methyltransferase From Plant Pathogenic Fungi

贾明轩 1周贺 1王茂存 1孙菡笛 1程圳 1范永山 2巩校东 1谷守芹 1刘玉卫 1董金皋1
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作者信息

  • 1. 河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室/华北作物改良与调控国家重点实验室,保定071000
  • 2. 唐山师范学院生命科学系,唐山063002
  • 折叠

摘要

RNA甲基化是最主要的RNA修饰方式,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰,在生物生长发育过程中发挥重要的调控作用.作为RNA甲基化修饰的重要蛋白,RNA甲基转移酶在植物病原真菌中的功能尚未见报道.本研究利用生物信息学方法,对植物病原真菌RNA甲基转移酶的结构及功能进行了初步探究.结果表明,在106种植物病原真菌中,共鉴定到159个RNA甲基转移酶基因,通过理化性质分析可知,159个植物病原真菌RNA甲基转移酶编码氨基酸的平均长度约为470 aa(变化范围:179~1206 aa),平均相对分子量约为52.64 kD(变化范围:20.04~134.35 kD),平均等电点约为7.26(变化范围:4.90~10.28).植物病原真菌RNA甲基转移酶的进化关系较为保守,相同门的植物病原真菌RNA甲基转移酶大体聚集在同一进化枝,且同一进化枝中蛋白保守基序的相似性较高.利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法对玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)中编码RNA甲基转移酶(S.turcica RNA methyltransferases 1,StMETTL1)的基因在病菌不同发育时期的表达量进行分析发现,StMETTL1在侵染钉时期的表达量显著升高(P<0.05),推测StMETTL1可能在玉米大斑病菌侵染宿主过程中发挥了重要的作用.本研究为进一步了解m6A在植物病原真菌中的作用提供了数据支持.

关键词

植物病原真菌/mRNA甲基化/RNA甲基转移酶/生物信息学分析

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量2
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