农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(10) :1869-1883.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.10.002

铁皮石斛白绢病响应miR171b及miR171b靶标DcGRAS基因家族的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Southern Blight Disease Responding miR171b and miR171b's Target DcGRAS Gene Family in Dendrobium catenatum

赖丹妮 蔡翔 陈东红 韩之刚 吴令上 斯金平 李聪
农业生物技术学报2022,Vol.30Issue(10) :1869-1883.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.10.002

铁皮石斛白绢病响应miR171b及miR171b靶标DcGRAS基因家族的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Southern Blight Disease Responding miR171b and miR171b's Target DcGRAS Gene Family in Dendrobium catenatum

赖丹妮 1蔡翔 1陈东红 1韩之刚 1吴令上 1斯金平 1李聪1
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作者信息

  • 1. 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室/国家林业局铁皮石斛工程技术研究中心,临安311300
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摘要

铁皮石斛(Dendrobium catenatum)是多年生草本药用植物,具有益胃生津的功效.白绢病是翠雀小核菌(Sclerotium delphinii)引发的一种广谱性真菌病害,在铁皮石斛近野生栽培中一旦发病可造成全年绝收,危害巨大.本研究对翠雀小核菌侵染后的铁皮石斛进行Small RNA组和转录组测序,筛选到受microRNA171b(miR171b)调控并响应翠雀小核菌侵染的靶基因DoNSPL2-2和DoNSPL2-5,在翠雀小核菌侵染后,DoNSPL2-2与DoNSPL2-5的表达显著提高(P<0.05).采用生物信息学对铁皮石斛GRAS(gibberellic acid insensitive(GAI),repressor of GAI(RGA),and scarecrow(SCR))基因家族成员进行了鉴定和分析.结果显示,铁皮石斛51个GRAS基因家族成员被分为11个亚族,其蛋白质序列长度为345~757个氨基酸;蛋白质的相对分子质量范围为39.2740~85.6616 kD,蛋白质理论等电点为4.59~7.52,均含有GRAS保守结构域.转录组数据显示,DoNSPL2-2与DoNSPL2-5在铁皮石斛的根中表达显著上调(P<0.05);干旱胁迫中,DoSCL21-2与DoSCL3-3的表达量随时间延长而显著上调(P<0.05);低温胁迫中,DoCIGR1与DoSCL23-like的表达量较对照组显著上调(P<0.05).本研究对铁皮石斛miR171b及其靶基因GRAS家族进行了分析,初步阐明了miR171b-GRAS调控模型参与调控铁皮石斛防御白绢病的分子机制,为铁皮石斛抗白绢病育种提供理论依据.

关键词

铁皮石斛/GRAS转录因子/白绢病/抗病育种/microRNA171b/(miR171b)

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量15
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