农业生物技术学报2022，Vol.30Issue(12) ：2333-2343.

苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测

Tissue Expression of Lnc_000588 in Sunite Sheep (Ovis aries) and Prediction of Its Interaction Molecules in Regulating Muscle Growth and Development

宫文典 王瑞雪 王荣 刘俊阳 穆卿 特日格勒 吴子贤 李蕴华 刘佳森 赵艳红
农业生物技术学报2022，Vol.30Issue(12) ：2333-2343.
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苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测

Tissue Expression of Lnc_000588 in Sunite Sheep (Ovis aries) and Prediction of Its Interaction Molecules in Regulating Muscle Growth and Development

宫文典 1王瑞雪 1王荣 1刘俊阳 1穆卿 1特日格勒 1吴子贤 2李蕴华 2刘佳森 2赵艳红1
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作者信息

  • 1. 内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室,呼和浩特010018
  • 2. 内蒙古自治区农牧业科学院畜牧研究所,呼和浩特010031
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摘要

苏尼特羊(Ovis aries)是我国优质的肉羊资源,也是我国北方地区主要羊肉来源之一.长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)在绵羊肌肉发育中发挥重要作用.为预测Lnc_000588在苏尼特羊骨骼肌发育中的调控网络,本研究对其在不同部位的组织表达量进行了实时荧光定量PCR分析及靶向miRNA-mRNA的生物信息学互作预测.同时,在小鼠(Mus musculus)成肌纤维细胞(C2C12)中检测了Lnc_000588的表达量.Lnc_000588在各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);Lnc_000588在C2C12细胞中的表达量随着细胞分化时间的延长而增加,48 h以后极显著高于较早时的表达(P<0.01).;Lnc_000588可能通过miRNA参与调控肌肉的生长发育,其中的3个miRNA的靶基因富集于Ras信号通路(oas04014:Ras signaling pathway)、Rap1信号通路(oas04015:Rap1 signaling pathway)和AMPK信号通路(oas04152:AMPK signaling pathway)等66条通路.综上,Lnc_000588在苏尼特羊肌肉组织的表达量极显著高于其他组织,推测其参与了C2C12细胞分化.本研究为探究LncRNA参与苏尼特羊肌肉组织的调控功能提供了科学依据.

关键词

长链非编码RNA(LncRNA)/苏尼特羊/肌肉/靶基因

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基金项目

出版年

2022
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
参考文献量8
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