农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(1) :115-123.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.01.011

基于SSR标记的山东地方鸡种遗传多样性和群体遗传结构分析

Genetic Diversity and Population Genetic Structure Analysis of Shandong Local Chicken (Gallus gallus) Breeds Based on SSR Markers

周艳 雷秋霞 韩海霞 刘杰 李福伟 刘玮 王杰 李大鹏 曹顶国
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(1) :115-123.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.01.011

基于SSR标记的山东地方鸡种遗传多样性和群体遗传结构分析

Genetic Diversity and Population Genetic Structure Analysis of Shandong Local Chicken (Gallus gallus) Breeds Based on SSR Markers

周艳 1雷秋霞 1韩海霞 1刘杰 1李福伟 1刘玮 1王杰 1李大鹏 1曹顶国1
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作者信息

  • 1. 山东省农业科学院家禽研究所,济南250023;山东省家禽育种工程技术研究中心,济南250023
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摘要

为评估山东省地方鸡(Gallus gallus)种质资源遗传多样性现状,为山东省地方鸡种质资源管理及创新利用提供科学参考依据,本研究利用20对微卫星标记对6个山东省地方鸡种、1个培育品系以及1个省外鸡种共计480个个体进行基因分型,采用软件分析山东省地方鸡种的遗传多样性和群体遗传结构.结果表明,20个多态位点在8个群体中共检测到226个等位基因,平均每个位点11.3个,PIC为0.711.群体平均等位基因为6.625个,观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity,He)的平均值分别为0.579和0.666.分子方差分析结果显示,8个鸡群体间变异为18%,群体内变异为82%,遗传变异主要来自于群体内不同的个体间.聚类分析和主成分分析(principal coordinates analysis,PCoA)结果具有一致性,8个群体被分为3大类,济宁百日鸡(JB)、莱芜黑鸡(LH)、鲁禽鸡(LQ)、琅琊鸡(LY)、鲁西微型鸡(LL)和寿光鸡(SG)率先聚为一类,石歧杂鸡(SQ)和汶上芦花鸡(WL)均单独聚为一类.研究表明,8个群体均具有丰富的遗传多样性,分类结果与各品种地理位置分布以及相互关系基本一致,本研究为山东省地方鸡种的保护、评价及开发利用提供重要的理论依据.

关键词

山东//地方品种/微卫星/遗传多样性

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基金项目

山东省农业良种工程项目(2019LZGC019)

山东省农科院农业科技创新工程项目()

山东省农业良种工程项目(2020LZGC013)

国家肉鸡产业技术体系建设项目济南综合试验站项目(CARS-41)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量12
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