农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(2) :223-231.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.02.001

小麦Whirly基因家族的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Wheat (Triticum aestivum) Whirly Gene Family

孙月 杨慧玉 朱文根 王小燕 唐益苗
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(2) :223-231.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.02.001

小麦Whirly基因家族的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Wheat (Triticum aestivum) Whirly Gene Family

孙月 1杨慧玉 2朱文根 2王小燕 1唐益苗2
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作者信息

  • 1. 长江大学农学院,荆州434000
  • 2. 北京市农林科学院杂交小麦研究所,北京100000
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摘要

Whirly家族属于植物特有的转录因子,在多种植物生长发育、抗病和胁迫响应等方面发挥着重要作用.为探究小麦(Triticum aestivum)Whirly家族成员数量及潜在功能,本研究借助生物信息学方法,对鉴定到的6个TaWHYs成员(分别命名为TaWHY1-A,TaWHY1-A-1,TaWHY1-D,TaWHY2-A,TaWHY2-B,TaWHY2-D)进行蛋白理化性质、基因结构、蛋白三维结构及系统进化分析;使用qPCR对TaWHYs成员在干旱、高温、低温胁迫下的表达模式进行分析.结果表明,TaWHYs蛋白不稳定指数为30~60,亲水性平均系数小于0,蛋白性质稳定,属于亲水蛋白.亚细胞定位预测显示,TaWHYs蛋白在细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体中均有分布.TaWHYs蛋白二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,存在2种三维结构模型.转录组数据分析表明,TaWHY基因表现出不同的组织表达模式,并受到低温、高温、干旱等不同非生物胁迫的调控.qPCR结果表明,TaWHY1-A基因在低温胁迫条件下相对表达量显著上调(P<0.05),能够响应低温胁迫.本研究结果为更深层次的TaWHY功能验证和作用机理分析提供参考.

关键词

小麦/Whirly基因家族/生物信息学分析/非生物胁迫/表达分析

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基金项目

北京市农林科学院协同创新中心项目(KJCX201907-2)

北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20200423)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量2
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