农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(2) :250-258.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.02.004

马铃薯StERF5基因的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StERF5 Gene in Potato (Solanum tuberosum)

王睿 濮雪 王凯彤 张欢欢 张宁 司怀军
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(2) :250-258.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.02.004

马铃薯StERF5基因的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StERF5 Gene in Potato (Solanum tuberosum)

王睿 1濮雪 1王凯彤 1张欢欢 2张宁 2司怀军2
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070
  • 2. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070;甘肃农业大学省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,兰州730070
  • 折叠

摘要

AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)家族是植物中转录因子家族之一,ERF亚家族为AP2/ERF家族的主要成员,本研究对马铃薯(Solanum tuberosum)StERF5基因进行了生物信息学分析、亚细胞定位及基因表达量分析,以进一步明确该基因的功能.结果表明,马铃薯StERF5编码243个氨基酸,含1个AP2结构域;亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞核与细胞膜;组织特异性表达分析显示StERF5基因在根、茎、叶中均有表达,根中的表达量最高,在茎中存在极显著品种差异(P<0.01),在干旱与盐处理下均呈上调表达.本研究为后续深入了解StERF5的功能奠定了基础.

关键词

马铃薯/StERF5/生物信息学/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金(31960444)

国家自然科学基金(31660416)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量3
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