农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(3) :445-459.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.03.001

小麦PDR基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of PDR Gene Family in Wheat (Triticum aestivum)

何浩 王志明 张立强 唐艺真 夏琪 李忠源 张怀渝
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(3) :445-459.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.03.001

小麦PDR基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of PDR Gene Family in Wheat (Triticum aestivum)

何浩 1王志明 1张立强 1唐艺真 1夏琪 1李忠源 1张怀渝1
扫码查看

作者信息

  • 1. 四川农业大学生命科学学院,雅安625014
  • 折叠

摘要

多向耐药性蛋白(pleiotropic drug resistance,PDR)是ABC转运蛋白超家族重要的亚家族成员,在响应外界胁迫和植物生长发育的生理过程中发挥着重要作用,但在小麦(Triticum aestivum)中研究较少.为探讨小麦PDR基因家族对逆境胁迫的响应,本研究对小麦PDR基因家族进行了全基因组鉴定和生物信息学分析,并通过qPCR方法验证其在非生物胁迫下的响应情况.结果显示,小麦中共鉴定出76个TaPDRs基因,主要位于3、5和7号染色体上,编码氨基酸1242~1517个,分子量为140.69~170.99 kD,预测等电点范围为6.22~8.94;系统进化分析将TaPDRs基因分为5类(ClassⅠ~Ⅴ),多数TaPDRs蛋白基序具有高度的保守性,同一类型TaPDRs具有较为相似的基因结构;基因复制分析共发现10组串联复制基因和56对片段复制基因;组织特异性分析发现,TaPDRs基因在小麦不同组织中的表达水平有较大差异,大多在根组织中高表达;qPCR结果显示,TaPDRs基因能够不同程度的响应盐、干旱、镉胁迫以及脱落酸处理.本研究为探索TaPDRs基因在非生物胁迫响应中的作用提供参考.

关键词

小麦/PDR基因家族/生物信息学分析/非生物胁迫

引用本文复制引用

基金项目

国家自然科学基金(31971940)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量6
段落导航相关论文