农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(3) ：509-517.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.03.006

马尾松SPL基因家族鉴定及其响应低磷胁迫的表达分析

Identification of SPL Gene Family in Pinus massoniana and Their Expression in Response to Low Phosphorus Stress

王春昱 范付华
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(3) ：509-517.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.03.006
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马尾松SPL基因家族鉴定及其响应低磷胁迫的表达分析

Identification of SPL Gene Family in Pinus massoniana and Their Expression in Response to Low Phosphorus Stress

王春昱 1范付华1
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作者信息

  • 1. 贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心/贵州省高原山地林木培育重点实验室,贵阳550025;贵州大学林学院,贵阳550025
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摘要

SPL(SQUAMOSA promoter binding protein(SBP)-like)是植物特有的转录因子,在植物生长发育和代谢中具有重要作用.本研究基于课题组前期获得的马尾松(Pinus massoniana)转录组数据筛选SPL家族成员,通过生物信息学方法,对马尾松SPL基因家族成员进行蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、保守蛋白基序(motif)分析和系统进化树分析.结果显示,在马尾松转录组数据中筛选出11个家族成员,预测所有家族成员定位于细胞核,编码蛋白质由190～1147个氨基酸组成,相对分子质量为21.6～127.1 kD;所有序列都含有motif1～3,为SBP结构域保守基序;11个PmSPL成员都含有2个C2HC锌指结构和1个核定位信号.利用qRT-PCR技术检测PmSPL基因家族对低磷胁迫的响应,结果显示,在低磷处理不同时间的马尾松幼苗地上和地下部分,PmSPL3和PmSPL8表达均没有显著变化,对低磷胁迫没有响应;PmSPL4和PmSPL6在低磷处理12 d的地上和地下部分均显著上调表达,可能在低磷胁迫响应中发挥作用.本研究结果为进一步揭示马尾松SPL基因响应低磷胁迫的生物学功能提供参考依据.

关键词

SPL基因家族/马尾松/生物信息学/低磷胁迫

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基金项目

贵州省科技计划(黔科合平台人才[2018]5261)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
被引量1
参考文献量11
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