农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(5) ：1001-1012.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.05.010

基于转录组测序技术对哈萨克马产奶量相关差异表达lncRNA的研究

Study of Differentially Expressed LncRNA Related to Milk Production in Kazakh Horses (Equus caballus) Based on Transcriptome Sequencing Technology

马应国 梁金超 马海玉 刘玲玲 刘武军
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(5) ：1001-1012.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.05.010
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基于转录组测序技术对哈萨克马产奶量相关差异表达lncRNA的研究

Study of Differentially Expressed LncRNA Related to Milk Production in Kazakh Horses (Equus caballus) Based on Transcriptome Sequencing Technology

马应国 1梁金超 1马海玉 1刘玲玲 1刘武军1
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作者信息

  • 1. 新疆农业大学动物科学学院,乌鲁木齐830052
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摘要

长链非编码RNA(long-chain non-coding RNA,lncRNA)已成为几乎所有基因功能和调控水平的重要参与者.为了揭示lncRNA对泌乳前期马(Equus caballus)产奶量的潜在作用,本研究选取8匹3～4岁体型相似、处于泌乳前期的健康哈萨克马,根据产奶量高低分为高产奶量组(H)和低产奶量组(L),利用转录组测序技术对2组马匹乳进行非编码RNA测序.通过GO和Pathway功能显著性富集分析来确定差异表达基因行使的主要生物学功能和参与的生化代谢途径及信号途径.按照P<0.05、FC≥1筛选出差异表达lncRNA并对差异表达lncRNA进行后续的功能研究.结果表明,在泌乳前期高产组和低产组的哈萨克马乳中共发现30个差异表达lncRNA(上调16个,下调14个).从中筛选出血管内皮生长因子-D(vascular endothlial growth factor,VEGFD)、磷脂酰肌醇聚糖类A(phosphatidylinositol glycan,class A,PIGA)、乌头酸酶-1(aconitase closing odor,ACO1)等与乳腺发育及泌乳相关的基因.研究结果表明,lncRNA可能通过靶向乳腺发育和泌乳相关基因来调控泌乳或乳腺发育的过程.本研究为lncRNA在马育种工作中的应用提供参考.

关键词

长链非编码RNA/(lncRNA)/哈萨克马/奶产量

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基金项目

新疆维吾尔自治区自然科学基金(2019D01B14)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
参考文献量6
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