农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(7) ：1357-1367.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.07.003

基于BSA-seq技术对番茄封顶花序节位基因的精细定位

Fine Mapping of Inflorescence Pruning Node Gene in Tomato (Solanum lycopersicum) Based on BSA-seq Technique

师海林 张丹丹 高倩 尤园园 舒金帅 王帅 毛秀杰
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(7) ：1357-1367.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.07.003
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基于BSA-seq技术对番茄封顶花序节位基因的精细定位

Fine Mapping of Inflorescence Pruning Node Gene in Tomato (Solanum lycopersicum) Based on BSA-seq Technique

师海林 1张丹丹 1高倩 2尤园园 1舒金帅 3王帅 4毛秀杰4
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作者信息

  • 1. 河北科技师范学院园艺科技学院,秦皇岛 066004
  • 2. 河北省农林科学院昌黎果树研究所,昌黎 066000
  • 3. 中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081
  • 4. 河北科技师范学院园艺科技学院,秦皇岛 066004;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室,秦皇岛 066004;河北省高校特色园艺植物生物育种应用技术研发中心,秦皇岛 066004
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摘要

主茎花序数的多少影响着自封顶类型番茄(Solanum lycopersicum)的产量,精细定位其封顶花序节位基因,可为进一步基因克隆以及功能分析、调控机理解析提供依据.本研究以低节位自封顶番茄品系AXF和高节位自封顶番茄品系GXF为亲本构建F2分离群体,应用混合群组分离分析测序(bulked segregant analysis sequencing,BSA-seq)和分子标记方法进行了连锁分析及基因定位.结果表明,关联区间位于2号染色体47.56～47.59 Mb,大小约为25497 bp,含有3个候选基因(硫代硫酸硫转移酶18(thiosulfatesul furtransferase 18,TST18)(GenBank No.XM_004232452.4),MLO类家族蛋白4(MLO-like protein 4,MLO4)(GenBank No.XM_019212390.2)和26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基4(26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4,PSMD4)(GenBank No.XM_010318126.3)).进一步开发 118 对InDel(insertion-deletion)/CAPS(cleaved amplified polymorphism sequences)/dCAPS(derived CAPS)引物进行精细定位,筛选获得1对多态性高的dCAPS14分子标记,该标记与PSMD4紧密连锁.qRT-PCR分析表明该候选基因在两个亲本不同组织中的表达量存在显著性差异.PSMD4功能为参与泛素-蛋白酶体系统介导的蛋白降解,可能对番茄封顶花序节位起着重要调控作用.本研究对分子辅助选育易于栽培操作的理想型自封顶番茄品种具有重要意义.

关键词

自封顶番茄/混合群组分离分析测序(BSA-seq)/分子标记/基因定位

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基金项目

河北省重点研发计划(20326325D)

河北省省属高校基本科研业务费专项(2021JK07)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
参考文献量7
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