农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(7) :1513-1521.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.07.016

灰葡萄孢Homeodomain家族基因的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of Homeodomain Family Genes in Botrytis cinerea

李白 魏雅迪 刘英姿 曹宏哲 张康 邢继红 董金皋
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(7) :1513-1521.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.07.016

灰葡萄孢Homeodomain家族基因的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of Homeodomain Family Genes in Botrytis cinerea

李白 1魏雅迪 2刘英姿 3曹宏哲 2张康 1邢继红 1董金皋1
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作者信息

  • 1. 省部共建华北作物改良与调控国家重点实验室,保定 071000;河北省植物生理与分子病理学重点实验室,保定 071000
  • 2. 河北省植物生理与分子病理学重点实验室,保定 071000
  • 3. 河北省承德市园林管理中心,承德067000
  • 折叠

摘要

Homeodomain家族基因在病原菌的分生孢子发育、致病过程以及胁迫响应过程中发挥重要作用.本研究利用生物信息学方法,在全基因组水平上对灰葡萄孢Homeodomain家族基因进行鉴定,并对其蛋白理化性质、系统进化关系、保守结构域及其在病菌分生孢子发育时期和侵染时期的表达规律进行分析;同时,利用qPCR技术,检测灰葡萄孢Homeodomain家族基因在NaCl、刚果红处理后的表达情况.结果发现,灰葡萄孢基因组中共包含14个Homeodomain家族基因,系统进化分析将其分为4个亚家族;灰葡萄孢Homeodomain家族基因均含有Homeodomain家族典型的SANT结构域,部分基因在分生孢子的不同发育时期和侵染时期上调表达,在NaCl和刚果红处理后Homeodomain家族基因表达水平存在明显差异,表明灰葡萄孢Homeodomain家族基因在病菌生长发育、侵染过程以及响应胁迫方面发挥重要的作用,本研究为阐明灰葡萄孢Homeodomain家族基因的功能及其作用机制提供了理论依据.

关键词

灰葡萄孢/Homeodomain家族基因/生物信息学分析/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金(31972217)

国家自然科学基金(32072369)

中央引导地方科技发展基金(206Z6501G)

河北省自然科学基金(C2022204040)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量5
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