农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(8) ：1671-1683.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.08.011

黑果枸杞花青素介导低氧诱导的H9c2大鼠心肌细胞ceRNA调控网络构建

Construction of ceRNA Regulatory Network in Hypoxia-induced H9c2 Rat Cardiomyocytes Mediated by Lycium ruthenicum Anthocyanins

李金铭 吴华 舒美玲 沈童 武小庆 王硕 李汶蒲
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(8) ：1671-1683.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.08.011
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黑果枸杞花青素介导低氧诱导的H9c2大鼠心肌细胞ceRNA调控网络构建

Construction of ceRNA Regulatory Network in Hypoxia-induced H9c2 Rat Cardiomyocytes Mediated by Lycium ruthenicum Anthocyanins

李金铭 1吴华 1舒美玲 1沈童 1武小庆 1王硕 1李汶蒲1
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作者信息

  • 1. 青海大学农牧学院,西宁 810016
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摘要

环状RNAs(circular RNAs,circRNAs)作为高效竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA),通过miRNA海绵效应调节细胞分化、增殖、凋亡和能量代谢等参与调控低氧诱导的细胞生物过程.黑果枸杞(Lycium ruthenicum)富含花青素(anthocyanins).花青素具有较强的抗氧化能力,可以有效缓解心肌细胞缺氧损伤.本研究利用RNA-seq技术和生物信息学方法筛选差异表达的circRNA、miRNA和mRNA,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络,利用qRT-PCR筛选可能参与黑果枸杞花青素对低氧诱导的H9c2大鼠(Rattus norvegicus)心肌细胞调控的ceRNA关系对.结果显示,差异表达的1570个mRNAs、5个miRNAs和4个circRNAs是低氧相关分子,可能参与黑果枸杞花青素对低氧诱导的H9c2大鼠心肌细胞的调控.基于皮尔逊相关性分析和靶关系预测,成功构建ceRNA网络,并利用qRT-PCR筛选到2个候选的circRNA-miRNA-mRNA关系对.本研究为深入探讨circRNA及其靶基因参与调控黑果枸杞花青素对心肌细胞保护作用的机制提供基础资料.

关键词

黑果枸杞花青素/H9c2大鼠心肌细胞/环状RNA(circRNA)/竞争性内源RNA(ceRNA)网络/低氧/保护效应

Key words

Lycium ruthenicum anthocyanins/H9c2 rat cardiomyocytes/Circular RNA(circRNA)/Competing endogenous RNA(ceRNA)network/Hypoxia/Protective effect

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基金项目

青海省科学技术厅自然科学基金(2022-ZJ-927)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
参考文献量8
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