农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(9) :1816-1831.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.09.004

茶树细胞壁关联蛋白激酶基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of the Wall-associated Kinase Gene Family in Camellia sinensis

焦小雨 吴琼 刘丹丹 孙明慧 王文杰
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(9) :1816-1831.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.09.004

茶树细胞壁关联蛋白激酶基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of the Wall-associated Kinase Gene Family in Camellia sinensis

焦小雨 1吴琼 1刘丹丹 1孙明慧 1王文杰1
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作者信息

  • 1. 安徽省农业科学院茶叶研究所,合肥230001
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摘要

细胞壁关联蛋白激酶(wall-associated kinase,WAK)是一类特殊的类受体蛋白激酶(receptor like kinase,RLK),在调节细胞生长和防御胁迫反应等方面发挥着重要作用.本研究利用生物信息学方法从茶树(Camellia sinensis)全基因组中鉴定出27个CsWAK成员,主要以基因簇的形式分布于2个染色体和1个组装片段上.根据系统进化关系将CsWAK分为5个亚组(Ⅰ~Ⅴ),同一亚组中的多数成员具有相似的基因结构和保守基序.转录组数据分析结果显示,大多数CsWAK成员在茶树的叶中高表达,其次是在根和茎中.在激素、低温、高盐等逆境胁迫下,CsWAK中多数成员基因表达变化差异不明显,少数基因表达变化显著,具有多样化和特异性.此外,对部分响应冷胁迫、PEG胁迫和盐胁迫的差异表达基因进行了qPCR分析.结果显示,低温处理下,所选9个基因均呈现先上升后下降的表达模式,且多数基因在低温处理3h表达水平上调最为明显;在PEG处理下,所选9个基因的表达水平与转录组数据略有不同,但表达趋势相似;在NaCl处理下,所选9个基因的表达水平较未处理时显著下调,其中,CsWAK14对盐胁迫最为敏感.本研究结果为进一步解析CsWAK基因的生物学功能提供参考.

关键词

茶树/细胞壁关联蛋白激酶(WAK)基因家族/胁迫应答/生物信息学

Key words

Camellia sinensis/Wall-associated kinase(WAK)gene family/Stress response/Bioinformatics

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基金项目

安徽省重大专项(202003a06020021)

安徽省茶叶产业技术体系建设项目(AHCYJSTX-11)

安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室开放基金(SKLTOF20220120)

安徽省农科院成果推广项目(2023YL031)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量5
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