农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(10) :2072-2086.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.10.007

闽楠NRT/NPF基因家族鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of NRT/NPF Gene Family in Phoebe bournei

李翼贝 童再康 韩双 王立 韩潇 张毓婷 杨琪 黄华宏 张俊红
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(10) :2072-2086.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.10.007

闽楠NRT/NPF基因家族鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of NRT/NPF Gene Family in Phoebe bournei

李翼贝 1童再康 1韩双 1王立 1韩潇 1张毓婷 1杨琪 1黄华宏 1张俊红1
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作者信息

  • 1. 浙江农林大学林业与生物技术学院/省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州311300
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摘要

氮素作为植物不可或缺的大量元素,其含量显著影响植物生长发育,其中硝态氮为闽楠(Phoebe bournei)等诸多陆生植物氮素吸收的主要形式,对硝酸盐转运蛋白(nitrate transporter/peptide transporter family,NRT/NPF)基因家族鉴定与表达分析具重要意义.本研究利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)NRT蛋白序列和隐马科夫模型(PF00854,PF07690和PF16974)在闽楠全基因组鉴定出63个NRT/NPF家族成员,不均匀分布于11条染色体,其分子量为22.8~135.6 kD,等电点为5.44~9.41,编码205~1235个氨基酸,其编码蛋白多为碱性蛋白,且含有2~23个跨膜结构域;系统进化分析将63个PbNRT/NPF分为3个亚家族,其中60个属于NRT1/NPF亚家族,2个属于NRT2亚家族,1个属于NRT3亚家族.共线性分析表明,PbNRT/NPF发生了9个串联重复事件和10个片段重复事件.转录组数据和qRT-PCR分析均表明,PbNRT/NPF成员在叶、根皮部、根木质部、茎皮部和茎木质部5种组织中的表达模式存在显著差异,其中硝酸盐转运蛋白基因PbNPF6.3在根皮部表达显著高于其他组织.qPCR结果表明,PbNRT/NPF成员在不同低氮处理阶段呈差异表达,其中PbNRT2.4和PbNRT2.5表达量在低氮处理下显著上升.本研究为进一步探索PbNRT/NPF家族成员在氮素吸收、转运和利用中的生物学功能提供了重要基础,为闽楠氮素高效利用新品种选育提供依据.

关键词

闽楠/硝酸盐转运蛋白(NRT/NPF)/基因家族/低氮胁迫/表达分析

Key words

Phoebe bournei/Nitrate transporter/peptide transporter family(NRT/NPF)/Gene family/Low-nitrogen stress/Expression analysis

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基金项目

浙江省农业新品种选育重大专项(2021C02070-10)

浙江省重点研发计划(2021C02054)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量9
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