摘要
江西省拥有众多的地方鸡(Gallus gallus domesticus)品种.为研究江西地方鸡品种的遗传多样性和系统发育关系,本研究采集了江西不同地区的6个地方鸡品种(安义瓦灰鸡,白耳黄鸡,崇仁麻鸡,丝羽乌骨鸡,东乡绿壳蛋鸡和余干乌骨鸡)的198份血液样本,采用PCR扩增与核酸测序技术相结合的方法对这6个江西地方鸡品种线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NADH)脱氢酶亚基6(NADH dehydrogenase subunit 6,ND6)基因全序列进行了检测.结果表明,6个江西地方鸡品种的ND6基因序列全长为522 bp,共计检测到7个核苷酸多态位点,根据序列变异共确定了7种单倍型,其中Hap1为主流单倍型.核苷酸多样性、单倍型多样性和平均核苷酸差异分别为0.00275±0.00086、0.694±0.024和1.437.中介网络图分析显示,6个江西地方鸡品种单倍型呈星状发散分布.系统发育分析发现,丝羽乌骨鸡、东乡绿壳蛋鸡和余干乌骨鸡聚为一支,安义瓦灰鸡、白耳黄鸡和崇仁麻鸡聚为一支.以上结果表明,江西地方鸡线粒体ND6基因多态信息含量丰富,乌骨鸡可能有不同的母系来源.该研究结果为江西地方鸡遗传资源的种质保护、品种选育和鉴定工作提供了参考.
基金项目
国家重点研发计划(2021YFD1200302)
国家重点研发计划(2021YFD1200305)
江苏省自然科学基金(BK20221412)
江苏省现代农业产业技术体系建设专项(JATS[2021]399)
国家自然科学基金(31501917)
国家自然科学基金(31672382)
国家自然科学基金(31702079)
国家自然科学基金(31372277)
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