农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(10) :2150-2162.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.10.015

基于TMT蛋白质组学对Vero细胞粘附相关蛋白的研究

Study on Vero Cell Adhesion Related Proteins Based on TMT Proteomics

张潇文 杨晓莉 毕冬琳 杨东亮 刘方程 令世鑫 柏家林 李琼毅 张德荣
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(10) :2150-2162.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.10.015

基于TMT蛋白质组学对Vero细胞粘附相关蛋白的研究

Study on Vero Cell Adhesion Related Proteins Based on TMT Proteomics

张潇文 1杨晓莉 1毕冬琳 1杨东亮 1刘方程 1令世鑫 2柏家林 1李琼毅 1张德荣2
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作者信息

  • 1. 西北民族大学生物医学研究中心/甘肃省动物细胞技术创新中心,兰州 730030;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030
  • 2. 西北民族大学生物医学研究中心/甘肃省动物细胞技术创新中心,兰州 730030
  • 折叠

摘要

细胞-细胞及细胞-细胞外基质的粘附取决于细胞特有的粘附蛋白及其相关调节信号.非洲绿猴肾脏上皮细胞(African green monkey kidney epithelial cells,Vero)是流感病毒(Influenza virus)、新型冠状病毒(Novel coronavirus)等多种病毒繁殖、纯化和疫苗生产的优良细胞株,为进一步探寻与Vero细胞粘附相关的蛋白,继而有效提升大规模高密度悬浮培养,本研究利用基因修饰及无血清培养基细胞技术成功构建悬浮型Vero细胞,并通过串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)定量蛋白质组学技术对贴壁培养Vero细胞(adherent culture Vero,Adh_Vero)和悬浮培养Vero细胞(suspension culture Vero,Sus_Vero)中与细胞粘附性能相关的差异表达蛋白进行分析,以期为与悬浮培养Vero细胞粘附相关的候选靶基因筛选提供依据.结果表明,与Adh_Vero细胞相比,Sus_Vero细胞中表达差异显著的蛋白质有190个,其中上调表达蛋白116个,下调表达蛋白74个.通过GO功能注释和KEGG通路富集筛选获得与粘附相关的差异表达蛋白6个,其中5个上调表达蛋白分别是多配体蛋白聚糖-4(syndecan 4,SDC4)、肌动蛋白调节器(enabled homolog,ENAH)、肌球蛋白轻链12β(myosin light chain 12β,MYL12β)、肌球蛋白轻链激酶(myosin light chain kinas,MYLK)和封闭蛋白(occludin,OCLN),1种下调表达蛋白为整合素β2蛋白(integrin β2,ITGβ 2).qPCR检测表明,Sus_Vero中SDC4、OCLN、MYL12β、MYLK以及ENAH的mRNA水平极显著下调(P<0.01),ITGβ2的mRNA水平极显著上调(P<0.01).Western blot检测表明,Sus_Vero中SDC4蛋白表达量也比贴壁培养细胞中显著减少,与定量蛋白质组学蛋白质表达趋势一致.本研究结果初步揭示了Vero细胞的粘附机制,为进一步运用基因工程技术构建Sus_Vero提供了有效候选靶蛋白.

关键词

非洲绿猴肾脏上皮细胞(Vero)/细胞悬浮培养/蛋白质组学/细胞粘附/多配体蛋白聚糖-4(SDC4)

Key words

African green monkey kidney epithelial cells(Vero)/Cell suspension culture/Proteomics/Cell adhesion,Syndecan 4(SDC4)

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基金项目

国家自然科学基金(31860696)

兰州市人才创业创新项目(2020-RC85)

甘肃省自然科学基金(21JR11RA018)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量4
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