农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(11) ：2221-2230.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.11.001

马铃薯StbZIP10基因生物信息学及其锌胁迫下的表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StbZIP10 Gene Under Zinc Stress in Potato(Solanum tuberosum)

刘昊天 赵婧 唐勋 赵贵宾 朱永永 张宁 司怀军
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(11) ：2221-2230.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.11.001
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马铃薯StbZIP10基因生物信息学及其锌胁迫下的表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of StbZIP10 Gene Under Zinc Stress in Potato(Solanum tuberosum)

刘昊天 1赵婧 2唐勋 1赵贵宾 3朱永永 3张宁 1司怀军1
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院/省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,兰州 730070
  • 2. 甘肃省农业信息中心,兰州 730030
  • 3. 甘肃省农业技术推广总站,兰州 730020
  • 折叠

摘要

锌在植物生长和发育的许多方面发挥作用.但过量的锌和缺锌均会导致生理生化紊乱,形成锌胁迫.碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子在调控植物生长发育、响应胁迫应答方面具有重要作用.本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)品种'Atlantic'为材料,克隆得到StbZIP10基因(GenBank No.XM_006359636.1),该基因全长1653 bp,CDS长为819 bp,共编码272个氨基酸.生物信息学分析表明,StbZIP10是相对分子质量为29.68 kD的疏水性跨膜蛋白,具有典型的bZIP保守结构域.亚细胞定位结果显示,StbZIP10蛋白主要在细胞核和细胞膜上表达.利用qRT-PCR对马铃薯StbZIP10基因进行组织特异性表达分析,结果表明,StbZIP10基因在马铃薯根中表达量最高,叶中表达量最低,并且各组织之间表达量存在显著性差异.在缺锌条件下,马铃薯'Atlantic'和'陇薯7号'品种中StbZIP10的表达模式相同,都为根部表达量最高.在缺锌处理下,StbZIP10在两品种中的表达水平均有提升,但在品种'陇薯7号'的表达量显著高于'Atlantic'(P＜0.05),且3个时间段内趋势基本相同.本研究为进一步阐明StbZIP10基因功能提供了基础资料.

关键词

锌胁迫/马铃薯/StbZIP10/生物信息学/亚细胞定位

Key words

Zinc stress/Potato/StbZIP10/Bioinformatics/Subcellular localization

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基金项目

甘肃省农业农村厅科技项目(GNKJ-2021-25)

甘肃省农业农村厅科技项目(GNKJ-2021-26)

联合国世界粮食计划署(WFP)项目(WFPGSPP-1)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
被引量1
参考文献量5
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