农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(12) :2443-2453.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.001

玉米氯酸盐抗性全基因组关联分析

Genome Wide Association Study for Chlorate Resistance in Maize(Zea mays)

王孜慧 吉伟东 魏杰 王芸芸 王后苗 杨泽峰 徐辰武 李鹏程
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(12) :2443-2453.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.001

玉米氯酸盐抗性全基因组关联分析

Genome Wide Association Study for Chlorate Resistance in Maize(Zea mays)

王孜慧 1吉伟东 1魏杰 1王芸芸 1王后苗 1杨泽峰 1徐辰武 1李鹏程1
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作者信息

  • 1. 扬州大学农学院/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室,扬州 225009
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摘要

氯酸盐抗性是评价作物氮效率的重要指标.为了挖掘玉米(Zea mays)氯酸盐抗性的QTL和候选基因,本研究以283份玉米自交系为材料,分别在正常和氯酸盐处理下测定7个性状,计算各性状的氯酸盐抗性.结果表明,氯酸盐处理后叶绿素相对含量、株高、叶长、地上部干重均显著降低;全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)共定位到133个显著SNP位点,正常条件、氯酸盐处理及不同性状的氯酸盐抗性分别定位到51、53、29个显著SNPs;结合关联分析和转录组分析筛选到13个候选基因,包括剪切和多聚腺苷酸化特异性因子、N-乙酰基-5-羟色胺-O-甲基转移酶、MYB转录因子等.本研究为解析玉米氯酸盐抗性的遗传机制提供了候选基因,对于挖掘玉米氮高效关键基因位点和氮高效遗传改良具有一定的参考意义.

关键词

玉米/氯酸盐抗性/氮效率/全基因组关联分析(GWAS)/候选基因

Key words

Maize/Chlorate resistance/Nitrogen use efficiency/Genome wide association study(GWAS)/Candidate gene

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基金项目

国家自然科学基金(31902101)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量4
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