农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(12) ：2506-2518.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.006

芸豆CBF基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析

Identification of the CBF Gene Family in Phaseolus vulgaris and Its Expression Analysis Under Low Temperature Stress

龙子轩 刘伟 王玉萍 张晓旭 罗新锐 王智
农业生物技术学报2023，Vol.31Issue(12) ：2506-2518.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.006
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芸豆CBF基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析

Identification of the CBF Gene Family in Phaseolus vulgaris and Its Expression Analysis Under Low Temperature Stress

龙子轩 1刘伟 1王玉萍 1张晓旭 1罗新锐 1王智1
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070
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摘要

CBF(C-repeat binding factor)是在植物响应低温胁迫中发挥重要作用的一种可被快速诱导的关键信号转录因子.本研究对芸豆(Phaseolus vulgaris)CBF基因家族进行了生物信息学分析并利用转录组数据(RNA-seq)和qRT-PCR对芸豆CBF基因在低温胁迫下的表达进行了检测.结果表明,在芸豆中共鉴定出7个PvCBFs,不均匀分布在5条染色体上;系统进化分析发现,芸豆CBF成员被分为4个亚组(Ⅰ～Ⅳ),与基因结构和保守基序分析结果相同;共线性分析发现,芸豆和拟南芥(Arabidopsis thaliana)CBF基因家族之间存在5对直系同源基因对,PvCBFs基因之间存在6对旁系同源基因对;启动子分析发现,PvCBFs含有多种参与植物生长发育、激素以及逆境响应的顺式元件;组织表达分析发现,PvCBFs基因具有明显的组织表达特异性;qRT-PCR结果显示,3个PvCBFs在低温胁迫下显著上调表达(P＜0.05).本研究可为后续PvCBFs耐低温功能分析提供参考依据.

关键词

芸豆/CBF(C-repeat/binding/factor)/全基因组鉴定/进化分析/表达模式/低温胁迫

Key words

Phaseolus vulgaris/C-repeat binding factor(CBF)/Genome-wide identification/Phylogenetic analysis/Expression profile/Chilling stress

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基金项目

国家自然科学基金(31760351)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
参考文献量9
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