摘要
NAC转录因子作为陆生植物特有转录调控因子,在植物适应环境和抗逆境胁迫过程中发挥着积极的作用.本研究利用生物信息学手段在蓖麻(Ricinus communis)的全基因组中共鉴定到了不均匀分布在10条染色体上的74个NAC转录因子,并且发生了13次基因间的复制.系统进化分析显示,RcNACs与拟南芥(Arabidopsis thaliana)NACs共被分为8个亚簇,每一亚簇中的成员均含有NAM结构域和保守的motif 2,并且基因组成结构类似.在RcNACs的启动子区域共鉴定到了15种胁迫类、激素响应类和生长发育相关的顺式作用元件.组织表达谱表明,被检测到的54个RcNACs在蓖麻中拥有明显的组织表达特异性,且有39.8%的成员在蓖麻的雄花中高表达;胁迫表达谱表明,被检测到的61个RcNACs中除了6个基因不响应干旱胁迫和盐胁迫,其余分别有47.3%和49.1%的基因在盐和干旱胁迫的早期上调表达;低温表达谱显示,39个RcNACs中有64.1%的基因在胁迫早期上调表达.低温胁迫下的qRT-RCR检测结果显示,10个RcNACs对低温应答时间响应持久,多数基因有着双峰表达模式且在胁迫72h出现表达峰值,表明RcNACs是蓖麻的逆境胁迫响应基因.本研究可为RcNACs在蓖麻非生物胁迫的调控作用中提供理论参考.
基金项目
国家自然科学基金(32060492)
国家自然科学基金(31860389)
内蒙古自治区自然科学基金(2022MS03057)
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