农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(12) :2674-2684.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.021

梅花花色合成基因的qPCR内参基因筛选及验证

Screening and Validation of Reference Genes for qPCR Analysis of Flower Color Synthesis Genes in Prunus mume

叶勇 Henry Lusekelo INGWE 郑子飞 陈樱之 赵宏波 董彬
农业生物技术学报2023,Vol.31Issue(12) :2674-2684.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2023.12.021

梅花花色合成基因的qPCR内参基因筛选及验证

Screening and Validation of Reference Genes for qPCR Analysis of Flower Color Synthesis Genes in Prunus mume

叶勇 1Henry Lusekelo INGWE 1郑子飞 1陈樱之 1赵宏波 2董彬2
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作者信息

  • 1. 浙江农林大学风景园林与建筑学院,杭州 311300
  • 2. 浙江农林大学风景园林与建筑学院,杭州 311300;浙江农林大学浙江省园林植物种质创新与利用重点实验室,杭州 311300
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摘要

梅花(Prunus mume)是中国十大传统名花之一,园林应用广泛.随着梅花分子生物学研究的不断深入,筛选出适用于梅花花色合成基因qPCR分析的内参基因至关重要.本研究选择3个不同色系的共计6个梅花栽培品种,进行花色表型分析和花青素含量测定,发现花青素含量与梅花花瓣的颜色呈正相关.同时,利用qPCR技术,在梅花不同色系品种间对14个候选内参基因的表达进行检测,使用3种软件geNorm、NormFinder、BestKeeper和ΔCt方法进行表达稳定性分析,最后用RefFinder程序综合分析,得出最佳内参基因,并利用花青素合成相关基因进行验证.实验结果表明,3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)和肌动蛋白1(actin 1,ACT1)表达最为稳定,ACT3表达最不稳定.验证结果表明,以GAPDH和ACT1为内参基因时,花青素合成相关基因的表达模式相近,较多基因呈现显著的差异表达;当以ACT3作为内参基因时,花青素合成相关基因的表达模式与GAPDH和ACT1为内参基因的结果不同,而且只有少数基因呈现显著的差异表达.本研究为深入开展梅花花色合成相关基因的表达模式分析提供基础资料.

关键词

梅花/qPCR/内参基因/花青素

Key words

Prunus mume/qPCR/Reference gene/Anthocyanin

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基金项目

国家重点研发计划(2019YFD1001500)

国家重点研发计划(2018YFD100400)

浙江省农业(花卉新品种选育)新品种选育重大科技专项(2021C02071)

出版年

2023
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
参考文献量11
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