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基于DNA条形码对报春苣苔属进行系统发育分析

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报春苣苔属为苦苣苔科长蒴苣苔族的类群,该属物种为草本.草本植物物种进化较迅速,且野外杂交现象较为普遍.为了找到该属最适合建立系统发育关系的基因片段进行分类研究,本研究选取 19 个种的核基因(ITS)序列和叶绿体基因(trnL_F、atpB_rbcL)序列,以及 2 个外类群(小石蝴蝶Petrocosmea minor或者贵州半蒴苣苔Hemiboea cavaleriei)对该属进行系统发育关系重建.结果表明:核基因(ITS)建立的系统树支持率较低,但是分辨率较高且拓扑结构较好.单一叶绿体基因(trnL_F、atpB_rbcL)建成的 2 棵系统发育树支持率有明显提高,但是分辨率较低,且拓扑结构显示较弱.在 2 棵叶绿体基因树中,基因片段trnL_F建成的系统树拓扑结构相对较好,并且基因片段atpB_rbcL建成的系统树支持率较高,均为80%以上.进一步通过核基因和叶绿体基因片段综合建树,不管是在树形的拓扑结构上,还是分辨率和支持率上都有明显提高.因此,核基因ITS,叶绿体基因trnL_F、atpB_rbcL等 3 个DNA条形码均适合用于对报春苣苔属系统发育树的建立,但需要组合一起建树才能具有较高的可信度.由此可见,基因量越多,建立的系统发育树越稳健.

张梅、童琪、李晓芳

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贵州省植物园/西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室,贵州 贵阳 550004

植物分类学 分子系统学 DNA条形码 苦苣苔科 报春苣苔属

2024

农业与技术
中国科技期刊编辑学会,吉林省科学技术信息研究所

农业与技术

影响因子:0.343
ISSN:1671-962X
年,卷(期):2024.44(24)