通过构建绿色食品企业、行业协会、政府部门之间的三方演化博弈模型,探讨了在云南省绿色食品品牌治理过程中,不同场景下绿色食品企业、行业协会、政府部门的策略选择,并通过数值仿真,分析相关结论的策略选择演化稳定性、均衡点稳定性和影响关系。结果表明:一是绿色食品企业、行业协会、政府部门的策略选择相互影响;二是演化稳定策略受品牌治理的成本、收益、补贴、奖励影响;三是降低品牌治理成本或提升收益有利于绿色食品企业选择参与品牌治理、行业协会积极协助、政府部门高监管;四是政府部门适当给行业协会、绿色食品企业发放补贴,行业协会适当给绿色食品企业发放奖励,政府增加对下一级政府部门的奖励,可以激励三方共同参与品牌治理。