身处当下大环境,高新技术企业内部会计核算工作的优势更加明显,凭借其优势逐渐占据了企业财务管理的核心地位,是保障企业研发项目有序开展的必要方式。但是由于高新技术企业内部会计核算工作涉及的内容较多,如增值税、减免税、税款计提、往来账簿核对、期末结余、研发风险计提、收支等,关联的核算流程也较为复杂,再加上核算人员本身的专业水平一般,很容易在核算中出现疏忽,造成核算结果失真。基于此,本文主要探究了高新技术企业会计核算中存在的各种问题,如会计核算体系不够健全、项目预算科目与核算科目不统一、项目开发分析准备金不足、核算人员综合素质有待提升等,并对其提出一系列改进策略,具体策略有:健全会计核算体系、统一项目预算科目与核算科目、遵循谨慎原则提出足够准备金、提升核算人员综合素质等,可供参考借鉴。