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龙须菜5.8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析

Cloning and Sequence Analysis of 5.8S rRNA and ITS Region Between 18S and 28S rRNA of Gracilaria lemaneiformis(Rhodophyta)

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研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Cracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析.结果表明,龙须莱和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置.

李敏、隋正红、易恒、张学成、阎炳伦、朱明

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中国海洋大学海洋生命学院,山东,青岛,266003

淮海工学院海洋学院,江苏,连云港,222005

龙须菜 江蓠科 5.8S rRNA-ITS 系统发育

国家高技术研究发展计划(863计划)山东省教学改革研究课题江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题

2006AA10A413B050092007HS005

2009

中国海洋大学学报(自然科学版)
中国海洋大学

中国海洋大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.474
ISSN：1672-5174
年,卷(期)：2009.39(1)
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