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芜菁实时荧光定量PCR内参基因筛选

Internal Reference Genes Screening of Turnip by Real-Time Fluorescence Quantiative PCR

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为筛选适宜芜菁(Brassica rapa L.ssp.rapa)基因表达分析的内参基因,在ICG(http://icg.big.ac.cn/index.php/Main_Page)中以十字花科作物为参照选择10个候选内参基因.实时荧光定量PCR结果显示ACT、TIP41、Tub-a、UBC30、CyP、UBC216个内参基因重复性较好,均能特异扩增并有较高的扩增效率,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件对内参基因在不同组织中的表达稳定性进行分析,为芜菁基因差异表达研究提供可靠的内参基因,以确保分析结果的可靠性.结果 表明,ACT、Tub-a和CyP的M值大于geNorm程序的默认值1.5,稳定性相对较差,6个候选内参基因的表达稳定性排序为:UBC21=TIP41＞ UBC30＞ ACT＞ Tub-a＞ CyP,所以,UBC21和TIP41是最稳定的组合.NormFinder的分析结果显示稳定性排序为TIP41＞ ACT＞ Tub-a＞ UBC30＞ UBC21＞ CyP,TIP41为最优内参基因,与geNorm分析结果一致,BestKeeper分析结果同geNorm和NormFinder的结果一致.通过RefFinder软件综合分析得出TIP41和UBC21为芜菁不同组织基因表达分析比较理想的内参基因,本研究首次评价了芜菁内参基因的稳定性,为该物种基因表达分析提供了参考.

任延靖、韩睿、赵孟良

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青海大学农林科学院,青海西宁810016

青海大学三江源国家农牧业国家重点实验室,青海西宁810016

芜菁 内参基因 实时荧光定量PCR TIP41

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2021

青海农林科技
青海省农林科学院 青海省林学会 青海省农学会

青海农林科技

影响因子：0.183
ISSN：1004-9967
年,卷(期)：2021.(3)
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