首页|月季密码子使用模式及其偏好性分析

月季密码子使用模式及其偏好性分析

扫码查看
为了分析月季密码子使用偏好性及其成因,对月季1794个注释基因的密码子进行研究,结果表明:月季密码子的平均CAI含量为19%,平均GC3s含量为27.2%,平均ENC含量为52.8%,基因密码子第3位偏好使用A、T碱基,密码子的使用偏好性较弱.ENC-plot和PR2-plot分析表明月季密码子偏好性除了受中性突变影响外,还可能受如选择压力等因素影响.RSCU值分析显示月季37个高表达优越密码子中以A/U结尾的有24个,结合26个高频密码子最终确定18个最优密码子,其中15个以A/U结尾.该结果揭示了月季密码子的使用偏好性,为研究月季密码子的使用模式及月季经济性状的遗传改良提供参考.
Analysis of Codon Usage Patterns and Preference of Chinese Rose

李莉、王小东、王占林

展开 >

青海大学,青海 西宁 810016

青海大学农林科学院,青海 西宁 810016

西宁市北山林场,青海 西宁 810003

月季 密码子 偏好性

2019年度中央财政林业科技推广示范项目

青[2019]TG08

2023

青海农林科技
青海省农林科学院 青海省林学会 青海省农学会

青海农林科技

影响因子:0.183
ISSN:1004-9967
年,卷(期):2023.(1)
  • 12