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艰难拟梭菌SpoOA蛋白结构及分子特性的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Structure and Molecular Characteristics of SpoOA Protein from Clostridioides difficile

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为了分析艰难拟梭菌SpoOA蛋白的结构及分子特性,本研究从NCBI蛋白质数据库中下载艰难拟梭菌SpoOA蛋白的氨基酸序列,分别采用ProtParam、Motif Scan、PSIPRED、SMART等在线分析程序预测其理化性质、翻译后修饰位点、二级结构和保守结构域,并利用MEGA 6.06 软件为不同物种来源的SpoOA蛋白构建进化树.结果表明,艰难拟梭菌SpoOA蛋白序列长度为274 aa,分子量为30.85 kDa,等电点理论值为6.33,不存在信号肽及跨膜结构域,并定位于胞质中.SpoOA蛋白含有REC和SpoOA C两大结构域,二级结构由10 个α螺旋和10 个β折叠组成,含有6 个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1 个N-肉豆蔻酰化位点和1 个蛋白激酶C磷酸化位点.不同物种来源的SpoOA蛋白分为两大支,其中7 种芽孢杆菌聚为一支,4 种梭菌聚为另外一支.本研究运用生物信息学方法分析了艰难拟梭菌SpoOA蛋白的保守结构域及翻译后修饰位点,为进一步研究其调控毒素表达的机制提供参考.

Clostridioides difficileSpoOAProtein structureMolecular characteristicsBioinformatics

王芬、蔡其刚

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遂宁市中心医院,四川 遂宁 629000

青海大学畜牧兽医科学院,青海 西宁 810016

艰难拟梭菌 SpoOA 蛋白结构 分子特性 生物信息学

青海省科学技术厅项目青海省科学技术厅项目青海高端创新人才计划(2020)

2020-NK-1292023-NK-P29

2023

青海畜牧兽医杂志
青海省畜牧兽医学会 青海省畜牧兽医科学院

青海畜牧兽医杂志

影响因子：0.196
ISSN：1003-7950
年,卷(期)：2023.53(3)
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