摘要
应用生物信息学方法和QRT-PCR技术,系统分析和预测香港牡蛎Sox8基因的遗传进化、蛋白质的理化性质和结构特征及组织表达差异分析.结果表明:香港牡蛎Sox8基因编码区全长1374bp,共编码氨基酸457个.多重序列比较分析显示香港牡蛎Sox8核苷酸序列相似性与太平洋牡蛎最高,为96％,系统进化树分析显示在不同物种以及进化的过程中Sox8基因具有较高的保守性.Sox8蛋白质信息学分析结果表明该蛋白呈弱碱性,N端无信号肽存在,位于胞核中,含有HMG-box和Sox N等结构.定量分析结果显示:Sox8在香港牡蛎8种组织中均有表达,其中表达量最高的是血淋巴,其次是性腺和唇瓣,鳃中相对表达量最低.研究结果为今后阐明其在香港牡蛎性腺发育进程中的功能奠定了基础.
基金项目
广西科技重大专项子课题:(AA17204095-10)
北部湾海洋生物多样性养护重点实验室项目:(2018ZB04)
钦州学院校级科研项目:(2017KYQD216)
钦州学院校级科研提升项目:(2018KY0620)
香港巨牡蛎抗嗜水气单胞菌SSR序列分析及分子标记的筛选(201811607031)
NETL
NSTL
万方数据