为了分析牦牛SOCS3基因的理化性质,本研究利用RT-PCR扩增得到牦牛SOCS3基因编码区,将其翻译成对应的蛋白质氨基酸序列后,利用生物信息学初步分析了其分子特征.结果表明,牦牛SOCS3基因编码区包含690个核苷酸,编码229个氨基酸,与普通牛、水牛、大羚羊、绵羊、骆驼、野猪、虎、大熊猫和人的SOCS3基因核苷酸序列一致性分别为99.71％、99.57％、98.70％、98.26％、98.55％、94.20％、92.75％、92.03％和91.59％.生物信息学预测表明,牦牛SOCS3蛋白属于亲水蛋白,分子式C 1118 H 1750 N 310 O 338 S 6,预计平均分子量25.13 KD,理论等电点8.97,消光系数0.693,脂肪族系数73.23,主要分布在细胞核和细胞质,也分布在线粒体、细胞骨架等,具有潜在的磷酸化位点33个.在结构上,牦牛SOCS3蛋白含有SH2、SOCS盒结构域,二级结构主要以无规则卷曲、α-螺旋为主,还含延伸链和β-转角.本研究结果为进一步研究牦牛SOCS3提供数据信息.
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