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黄瓜PIP2;4基因生物信息学及干旱胁迫下的诱导表达分析

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[目的]探究黄瓜PIP2;4(CsPIP2;4 Gene ID:101215300)在干旱胁迫响应中的可能功能.[方法]以华北型黄瓜'9930'为试材,基于CsPIP2;4为前期研究筛选出的干旱胁迫下显著差异表达蛋白,克隆CsPIP2;4基因,对其进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR检测CsPIP2;4在干旱下的表达.[结果]生物信息学分析显示,CsPIP2;4 CDS序列有852 bp,编码283个氨基酸,CsPIP2;4蛋白具有疏水性、无信号肽段、有跨膜结构,是定位在质膜的内在蛋白,以无规则卷曲和α-螺旋结构为主,具有典型的水通道蛋白结构功能域,属于MIP超家族;蛋白质同源比对分析显示,CsPIP2;4与甜瓜PIP2;7的亲缘关系最近.qRT-PCR结果表明CsPIP2;4表达受干旱诱导.[结论]CsPIP2;4可能是参与黄瓜干旱胁迫应答过程重要基因,为后续鉴定其在黄瓜响应干旱中的功能奠定了基础.
Induced Expression in Drought Stress and Bioinformatic Analysis of PIP2;4 Gene in Cucumber

陈露倩、赖梦霞、柴里昂、李乐乐、王璐、杜长霞、樊怀福、朱祝军

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浙江农林大学农业与食品科学学院,杭州 311300

黄瓜 PIP2 4 生物信息学 干旱 表达分析

浙江省自然科学基金浙江省自然科学基金

LY18C150004LY18C150003

2020

10.16036/j.issn.1000-2650.2020.05.005

四川农业大学学报
四川农业大学

四川农业大学学报

CSCD北大核心
影响因子：0.657
ISSN：1000-2650
年,卷(期)：2020.38(5)
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